RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 NGFRP08138 427 aa7.19□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CCL3P10147 92 aa7.19□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.19□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 TRILQ7L0X0 811 aa7.19□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.19□□□□□ -1.26
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NANOG-201ENST00000229307 Q8N402 240 aa7.19□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.19□□□□□ -1.26
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NANOG-201ENST00000229307 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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NANOG-201ENST00000229307 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.19□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 NUP50Q9UKX7 468 aa7.19□□□□□ -1.26
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NANOG-201ENST00000229307 BHLHE40O14503 412 aa7.18□□□□□ -1.26
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NANOG-201ENST00000229307 R4GMQ9 66 aa7.18□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa7.18□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 NOTOA8MTQ0 251 aa7.18□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ZNF732B4DXR9 585 aa7.18□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.18□□□□□ -1.26
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