RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 C1orf198Q9H425 327 aa9.49□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 ELOVL3Q9HB03 270 aa9.49□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 TIGARQ9NQ88 270 aa9.49□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 B3GAT1Q9P2W7 334 aa9.49□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 FBXL2Q9UKC9 423 aa9.49□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.49□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 TVP23AA6NH52 213 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 IFITM5A6NNB3 132 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 FAM171A2A8MVW0 826 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 FAM25AB3EWG3 89 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 FAM25CB3EWG5 89 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 FAM25GB3EWG6 89 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 GMFGO60234 142 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 HPGDSO60760 199 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 PGA4P0DJD7 388 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 PGA3P0DJD8 388 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 TOMM20Q15388 145 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 BCL2A1Q16548 175 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 BAK1Q16611 211 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 PYDC2Q56P42 97 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 BICRALQ6AI39 1079 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 CNIH2Q6PI25 160 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 CATSPERDQ86XM0 798 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 Q8N402 240 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF676Q8N7Q3 588 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 RNF133Q8WVZ7 376 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 PSMF1Q92530 271 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 C4orf45Q96LM5 186 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 FAM173AQ9BQD7 235 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 MOB1AQ9H8S9 216 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 NOX4Q9NPH5 578 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 SLC17A5Q9NRA2 495 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 R4GMQ9 66 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa9.48□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 OR2M5A3KFT3 312 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 H3BML4 177 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 PIN1P1O15428 100 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 SERPINI2O75830 405 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 CSF3P09919 207 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 CCL3P10147 92 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 HLA-DOBP13765 273 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 ELK1P19419 428 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 GNLYP22749 145 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 BIDP55957 195 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 CLRN1P58418 232 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 IL18Q14116 193 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 TAB1Q15750 504 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 HYAL4Q2M3T9 481 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 C10orf128Q5T292 105 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 ABHD17BQ5VST6 288 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 STAC2Q6ZMT1 411 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 CREB3L2Q70SY1 520 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 NR2C2APQ86WQ0 139 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 ST7LQ8TDW4 575 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 PTX4Q96A99 478 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 TXNDC15Q96J42 360 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 GNRHR2Q96P88 292 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 OR14A2Q96R54 314 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 NEURL2Q9BR09 285 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 OR2B2Q9GZK3 357 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 DKKL1Q9UK85 242 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 HHLA2Q9UM44 414 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 RCE1Q9Y256 329 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 LRRK2Q5S007 2527 aa9.47□□□□□ -0.89
CDCA3-201ENST00000229265 ICE1Q9Y2F5 2266 aa9.46□□□□□ -0.9
CDCA3-201ENST00000229265 OR6C65A6NJZ3 312 aa9.46□□□□□ -0.9
CDCA3-201ENST00000229265 C17orf51A8MQB3 221 aa9.46□□□□□ -0.9
CDCA3-201ENST00000229265 CENPXA8MT69 81 aa9.46□□□□□ -0.9
CDCA3-201ENST00000229265 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CDCA3-201ENST00000229265 PLGP00747 810 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CDCA3-201ENST00000229265 SPARCP09486 303 aa9.46□□□□□ -0.9
CDCA3-201ENST00000229265 H2BFMP0C1H6 154 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms