RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 GMNCA6NCL1 334 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHMP01871 453 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SBK2P0C263 348 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF12P17014 697 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 GZMMP51124 257 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF154Q13106 437 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 MTX3Q5HYI7 312 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC80Q76M96 950 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SPICQ8N5J4 248 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 OR10A6Q8NH74 314 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM239Q8WW34 195 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 GPA33Q99795 319 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ALG12Q9BV10 488 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 AUP1Q9Y679 476 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 A8MXK9 166 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ANGPT2O15123 496 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5F1O95221 314 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CST2P09228 141 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TNFRSF1BP20333 461 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 LAP3P28838 519 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC6A9P48067 706 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ARHGDIAP52565 204 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TAS2R41P59536 307 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PSG7Q13046 419 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CDK5R2Q13319 367 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NFYCQ13952 458 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 LAPTM4AQ15012 233 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TAF11Q15544 211 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 VMACQ2NL98 169 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ALG10Q5BKT4 473 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ZER1Q7Z7L7 766 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPEARQ8WU66 669 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 STON2Q8WXE9 905 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 C4orf45Q96LM5 186 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SAMD8Q96LT4 415 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 MED31Q9Y3C7 131 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CLDN34H7C241 214 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ABHD16AO95870 558 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TNFRSF1AP19438 455 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TNFSF4P23510 183 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 RPL27P61353 136 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PCBD1P61457 104 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 BTG1P62324 171 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 IL13RA1P78552 427 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 BAMBIQ13145 260 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ZMYND11Q15326 602 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF774Q6NX45 483 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ARL9Q6T311 187 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TREML4Q6UXN2 200 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZR03 302 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SYT9Q86SS6 491 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 FNDC8Q8TC99 324 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC25A28Q96A46 364 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 RBP7Q96R05 134 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 MRI1Q9BV20 369 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 BAG5Q9UL15 447 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PPL8 197 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 POM121CA8CG34 1229 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PIP5K1CO60331 668 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 COX5BP10606 129 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms