RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 PRTN3P24158 256 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 LAP3P28838 519 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R41P59536 307 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMCX4Q5H9R4 360 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC80Q76M96 950 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP50Q9UKX7 468 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 NPIPB13A6NJU9 1138 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 NPIPB4C9JG80 1138 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC2LH3BP13 241 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BSA7 217 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 IGF2P01344 180 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 VIMP08670 466 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF154Q13106 437 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF774Q6NX45 483 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf174Q8IYL3 243 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 RASSF5Q8WWW0 418 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 DIRC2Q96SL1 478 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNIPQ9H3M7 391 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM106BQ9NUM4 274 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 RIMS3Q9UJD0 308 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TANC2Q9HCD6 1990 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5F1O95221 314 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHMP01871 453 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMAT1Q5H9K5 638 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 MTX3Q5HYI7 312 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 C4orf45Q96LM5 186 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEK2Q9NYT0 353 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 EGFL7Q9UHF1 273 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 AUP1Q9Y679 476 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 PIP5K1CO60331 668 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SASH3O75995 380 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 CST2P09228 141 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF12P17014 697 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 PSG7Q13046 419 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK5R2Q13319 367 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF11Q15544 211 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ALG10Q5BKT4 473 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ALG12Q9BV10 488 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 POFUT1Q9H488 388 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 MED31Q9Y3C7 131 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 WNK2Q9Y3S1 2297 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 GMNCA6NCL1 334 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 NR2C1P13056 603 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A9P48067 706 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 AGBL2Q5U5Z8 902 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL36Q8N4N3 616 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SPICQ8N5J4 248 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF283Q8N7M2 679 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ELOVL3Q9HB03 270 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 HIF3AQ9Y2N7 669 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 INSIG2Q9Y5U4 225 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1E2P47887 323 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGDIAP52565 204 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL27P61353 136 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 BAMBIQ13145 260 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM155Q4W5P6 130 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZR03 302 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 IGFN1Q86VF2 1251 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SIGLEC11Q96RL6 698 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 GPA33Q99795 319 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PPL8 197 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MXK9 166 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SCG5P05408 212 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 PCBD1P61457 104 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 BTG1P62324 171 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMYND11Q15326 602 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 RABL3Q5HYI8 236 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2Z1Q8NG97 314 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPEARQ8WU66 669 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 STON2Q8WXE9 905 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 RBP7Q96R05 134 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 MRI1Q9BV20 369 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 BAG5Q9UL15 447 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 F5H0A9 414 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 FBP2O00757 339 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD16AO95870 558 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 NANOGP8Q6NSW7 305 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ZER1Q7Z7L7 766 aa21.57■■□□□ 1.04
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