RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589864.1

TNNI3-208, Transcript of troponin I3, cardiac type, human

TSL 2

Gene TNNI3, Length 525 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNI3-208	ENST00000589864	RELB	Q01201	579 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ARL9	Q6T311	187 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ASB10	Q8WXI3	467 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	UBE2F	Q969M7	185 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	MPP4	Q96JB8	637 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	C4orf45	Q96LM5	186 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	IL19	Q9UHD0	177 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM178B	H3BS89	294 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	IFNL4	K9M1U5	179 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864		M0R3H8	397 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SURF4	O15260	269 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	THY1	P04216	161 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	F13B	P05160	661 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SELE	P16581	610 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	AQP1	P29972	269 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	UGT2B15	P54855	530 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	PDCD1	Q15116	288 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SGCA	Q16586	387 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	KRT71	Q3SY84	523 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF774	Q6NX45	483 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864		Q6YL49	198 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM86B	Q8N661	226 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	GMNC	A6NCL1	334 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC2A10	O95528	541 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	GSTM3	P21266	225 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	GNB2	P62879	340 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ERVK-25	P63136	954 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TAF11	Q15544	211 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	NPTX1	Q15818	432 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TAF9	Q16594	264 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	DUSP7	Q16829	419 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864		Q6ZR03	302 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SMYD1	Q8NB12	490 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	CHIA	Q9BZP6	476 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	INIP	Q9NRY2	104 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	VAPA	Q9P0L0	249 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	MIOX	Q9UGB7	285 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	CST2	P09228	141 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	NR2C1	P13056	603 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	KITLG	P21583	273 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	KRTAP10-3	P60369	221 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	PCBD1	P61457	104 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	KLB	Q86Z14	1044 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	MAGEB18	Q96M61	343 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	OR52B2	Q96RD2	323 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	MARCH7	Q9H992	704 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM165	Q9HC07	324 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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