RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589860.5

C18orf8-206, Transcript of Uncharacterized protein C18orf8, human

TSL 5

Gene C18orf8, Length 787 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C18orf8-206	ENST00000589860	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		13.94	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		13.94	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.94	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.94	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	JAM3	Q9BX67	310 aa		13.94	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		13.94	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	JKAMP	Q9P055	326 aa		13.94	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		13.94	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		13.94	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860		A0A087WXM4	84 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	DAPL1	A0PJW8	107 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	PHYH	O14832	338 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	APOL3	O95236	402 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	IGHA1	P01876	353 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SPARC	P09486	303 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	CHRNB4	P30926	498 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	HCCS	P53701	268 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	PIGF	Q07326	219 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	GABRA6	Q16445	453 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SKA3	Q8IX90	412 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	OTOS	Q8NHW6	89 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	THEM6	Q8WUY1	208 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	EMC7	Q9NPA0	242 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	NBAS	A2RRP1	2371 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		13.93	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	B4GALT1	P15291	398 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	MYL12A	P19105	171 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	COX5A	P20674	150 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	PCBD1	P61457	104 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	MVK	Q03426	396 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	LUZP2	Q86TE4	346 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SGCD	Q92629	289 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	CCDC120	Q96HB5	630 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SH3GL3	Q99963	347 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	C1orf198	Q9H425	327 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		13.92	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860		A0A096LPE4	126 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860		A0A1W2PPZ6	126 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	CDH15	P55291	814 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	HIST1H3A	P68431	136 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	ZNF85	Q03923	595 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	AQP6	Q13520	282 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	GALE	Q14376	348 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	IRF3	Q14653	427 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SLC36A2	Q495M3	483 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	OTP	Q5XKR4	325 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SPART	Q8N0X7	666 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.91	□□□□□ -0.18
C18orf8-206	ENST00000589860	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18

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