RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF85Q03923 595 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM27E3Q08E93 113 aa5.28□□□□□ -1.56
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CAPNS1-208ENST00000589162 OR2G6Q5TZ20 316 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.28□□□□□ -1.56
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CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP77Q6ZQR2 320 aa5.28□□□□□ -1.56
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CAPNS1-208ENST00000589162 AKR7LQ8NHP1 331 aa5.28□□□□□ -1.56
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CAPNS1-208ENST00000589162 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
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CAPNS1-208ENST00000589162 FKBP14Q9NWM8 211 aa5.28□□□□□ -1.56
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CAPNS1-208ENST00000589162 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNG2Q9UJ96 466 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa5.28□□□□□ -1.56
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CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RER1O15258 196 aa5.27□□□□□ -1.57
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CAPNS1-208ENST00000589162 STK11Q15831 433 aa5.27□□□□□ -1.57
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CAPNS1-208ENST00000589162 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX18Q96RF0 628 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 INTS14Q96SY0 518 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 COPS4Q9BT78 406 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.27□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GLRX2Q9NS18 164 aa5.27□□□□□ -1.57
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