RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 CDAP32320 146 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 OR3A2P47893 321 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 DOC2BQ14184 412 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM27BQ5VT28 67 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 CD163Q86VB7 1156 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 PHC2Q8IXK0 858 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF679Q8IYX0 411 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52N5Q8NH56 324 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 NABP1Q96AH0 204 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8B4Q96RC9 309 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 WACQ9BTA9 647 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 MROQ9BYG7 248 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf198Q9H425 327 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 SIAEQ9HAT2 523 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM38BQ9NVV0 291 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFB11Q9NX14 153 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 GNG8Q9UK08 70 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNHIT1O43257 154 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 PSKH1P11801 424 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS27P42677 84 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 CEACAM16Q2WEN9 425 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 TP53I3Q53FA7 332 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf185Q5T7R7 199 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 RPTNQ6XPR3 784 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ST7LQ8TDW4 575 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ISOC1Q96CN7 298 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 PELI1Q96FA3 418 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXB1Q99853 325 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ASF1BQ9NVP2 202 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 PRRG2O14669 202 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF254O75437 659 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 LALBAP00709 142 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 CD53P19397 219 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 RBPJQ06330 500 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 SSX1Q16384 188 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 SGCAQ16586 387 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 GFRALQ6UXV0 394 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 DCXRQ7Z4W1 244 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf106Q8NAJ2 232 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 WBP1Q96G27 269 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 MALT1Q9UDY8 824 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 IKZF2Q9UKS7 526 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 GABARAPO95166 117 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 EDN3P14138 238 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 TGM4P49221 684 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 LIPKQ5VXJ0 399 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF627Q7L945 461 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 LINGO2Q7L985 606 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 OR6K3Q8NGY3 331 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 TTTY10Q9BZA0 68 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 EMC7Q9NPA0 242 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
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CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD16AO95870 558 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMP3P35625 211 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 AQP6Q13520 282 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXW9Q5XUX1 488 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT77Q7Z794 578 aa27.32■■□□□ 1.96
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CAPNS1-206ENST00000588815 YIPF7Q8N8F6 280 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR32B1ATL7 298 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 PLPP2O43688 288 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 CD1AP06126 327 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 CELP19835 753 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 SIRPAP78324 504 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
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CAPNS1-206ENST00000588815 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00346Q8IVM7 164 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF133Q8WVZ7 376 aa27.32■■□□□ 1.96
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF416Q9BWM5 594 aa27.32■■□□□ 1.96
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CAPNS1-206ENST00000588815 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 OGG1O15527 345 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 FARS2O95363 451 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 CST2P09228 141 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8G3PP0DMU2 310 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 RTL6Q6ICC9 239 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 SYT9Q86SS6 491 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 GJC3Q8NFK1 279 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM215AQ9Y5M1 114 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 EDNRAP25101 427 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 GABRA5P31644 462 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 RIDAP52758 137 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 PER3P56645 1201 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
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