RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 CACNG6Q9BXT2 260 aa13.6□□□□□ -0.23
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CTIF-205ENST00000587860 CD14P08571 375 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 C14orf28Q4W4Y0 310 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 OR2I1PQ8NGU4 316 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 C8orf44Q96CB5 159 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 DLL4Q9NR61 685 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 UFSP2Q9NUQ7 469 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 GHRLQ9UBU3 117 aa13.59□□□□□ -0.23
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CTIF-205ENST00000587860 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
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CTIF-205ENST00000587860 SLC6A1P30531 599 aa13.59□□□□□ -0.23
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CTIF-205ENST00000587860 HIST1H2ACQ93077 130 aa13.59□□□□□ -0.23
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CTIF-205ENST00000587860 VN1R1Q9GZP7 353 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
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CTIF-205ENST00000587860 METTL21EPA6NDL7 271 aa13.58□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 SKP1P63208 163 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 FAM122BQ7Z309 247 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 TMPRSS12Q86WS5 348 aa13.58□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 HLA-DQB1P01920 261 aa13.58□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 SSX9Q7RTT3 188 aa13.58□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 SLC16A7O60669 478 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 IFNA4P05014 189 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 ABCD3P28288 659 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 PPICP45877 212 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.243e-6■□□□□ 10.8
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CTIF-205ENST00000587860 PLA1AQ53H76 456 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 FNDC7Q5VTL7 733 aa13.57□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 SMIM6P0DI80 62 aa13.57□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 FBXW4P57775 412 aa13.57□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 ACTG2P63267 376 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 HSD11B2P80365 405 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 FMODQ06828 376 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 OR2B11Q5JQS5 317 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 OR7E24Q6IFN5 339 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 FAM198BQ6UWH4 519 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 GLB1L2Q8IW92 636 aa13.57□□□□□ -0.24
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