RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CUTC	Q9NTM9	273 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	LRP4	O75096	1905 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PPL8	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PR77	199 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		A6NIZ1	184 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		A8MVM7	634 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		B4DGG1	531 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	AIP	O00170	330 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	HCRTR1	O43613	425 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF254	O75437	659 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	UTS2	O95399	124 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	LALBA	P00709	142 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	IGKV1D-16	P01601	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SPN	P16150	400 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SPI1	P17947	270 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	EDNRA	P25101	427 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	STOM	P27105	288 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SHC1	P29353	583 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ACVR1B	P36896	505 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	GABRA4	P48169	554 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PGD	P52209	483 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ART1	P52961	327 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC26A5	P58743	744 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RAP1B	P61224	184 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RAP1A	P62834	184 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ACY1	Q03154	408 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TNK1	Q13470	666 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	C1orf61	Q13536	156 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB32	Q13637	225 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CBFB	Q13951	182 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TOMM20	Q15388	145 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF74	Q16587	644 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NTRK2	Q16620	822 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		Q499Y3	187 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PATE1	Q8WXA2	126 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ARSG	Q96EG1	525 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MED20	Q9H944	212 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR76	Q9H967	626 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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