RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 CENPHQ9H3R5 247 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 POFUT1Q9H488 388 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF281Q9Y2X9 895 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 FMO6PO60774 539 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 THRBP10828 461 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 TNFRSF1AP19438 455 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 PAX2Q02962 417 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 CD47Q08722 323 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 Q6ZR03 302 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 SAMD8Q96LT4 415 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 SEPHS2Q99611 448 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 CHIAQ9BZP6 476 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 VAPAQ9P0L0 249 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 CLPSL1A2RUU4 121 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 H3BSA7 217 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 TSPAN15O95858 294 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 WNT2P09544 360 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ARHGDIAP52565 204 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 UGT2B15P54855 530 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 GNB2P62879 340 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF774Q6NX45 483 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 C4orf45Q96LM5 186 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 THAP1Q9NVV9 213 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 LAP3P28838 519 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 AQP2P41181 271 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 MMP16P51512 607 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 DUSP7Q16829 419 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 KLBQ86Z14 1044 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 OR2V2Q96R30 315 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 INIPQ9NRY2 104 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 CENPBD1B2RD01 187 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM178BH3BS89 294 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 NDUFA7O95182 113 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ABHD16AO95870 558 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 SELEP16581 610 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 GSTM3P21266 225 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 PPIBP23284 216 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 MOSPD2Q8NHP6 518 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 PFN4Q8NHR9 129 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 RNF114Q9Y508 228 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-211ENST00000574099 ICMTO60725 284 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 ALX3O95076 343 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 ERFP50548 548 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 STX1BP61266 288 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 FGF12P61328 243 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 TAF9Q16594 264 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 Q6YL49 198 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms