RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ACTC1P68032 377 aa16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ACTA1P68133 377 aa16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 GABRA6Q16445 453 aa16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SFRP5Q5T4F7 317 aa16.41■□□□□ 0.22
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SPNS1-210ENST00000568388 STX19Q8N4C7 294 aa16.41■□□□□ 0.22
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SPNS1-210ENST00000568388 ZNF454Q8N9F8 522 aa16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 OR6N2Q8NGY6 317 aa16.41■□□□□ 0.22
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SPNS1-210ENST00000568388 ZNF416Q9BWM5 594 aa16.41■□□□□ 0.22
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SPNS1-210ENST00000568388 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
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SPNS1-210ENST00000568388 SH3GL3Q99963 347 aa16.38■□□□□ 0.21
SPNS1-210ENST00000568388 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SPNS1-210ENST00000568388 OR10A4Q9H209 315 aa16.38■□□□□ 0.21
SPNS1-210ENST00000568388 C1orf198Q9H425 327 aa16.38■□□□□ 0.21
SPNS1-210ENST00000568388 ERVK13-1Q9NX77 482 aa16.38■□□□□ 0.21
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF224Q9NZL3 707 aa16.38■□□□□ 0.21
SPNS1-210ENST00000568388 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.38■□□□□ 0.21
SPNS1-210ENST00000568388 COPS3Q9UNS2 423 aa16.38■□□□□ 0.21
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