RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566035.5

SNAP23-211, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 3

Gene SNAP23, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-211	ENST00000566035	OR8B8	Q15620	311 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035		Q96M66	194 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	ZNF583	Q96ND8	569 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	LPA	P08519	4548 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035		A0A1W2PQ09	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035		G3V2L1	256 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035		M0R3G1	203 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	GYPA	P02724	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	APLNR	P35414	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	HNMT	P50135	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	SLURP1	P55000	103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	CLDN17	P56750	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	ECH1	Q13011	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	CHIT1	Q13231	466 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	XKR7	Q5GH72	579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	GPR151	Q8TDV0	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035		M0QZK8	103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	SLC22A2	O15244	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	ZNF208	O43345	1280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	RGS11	O94810	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	MBD3	O95983	291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	AMBP	P02760	352 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	AMY1A	P04745	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	AMY2A	P04746	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035		P0C879	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	CCNA2	P20248	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	COX7A1	P24310	79 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	LCN1	P31025	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	CXCR5	P32302	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	AQP5	P55064	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	PPP1CB	P62140	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	PHEX	P78562	749 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	PSG7	Q13046	419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	FOXE3	Q13461	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	DEFB135	Q30KP9	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	STPG2	Q8N412	459 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	MNT	Q99583	582 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-211	ENST00000566035	EPYC	Q99645	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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