RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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PTPRB-209ENST00000550857 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 CCL19Q99731 98 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.28□□□□□ -1.24
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