RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544179.1

TM7SF3-216, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 2

Gene TM7SF3, Length 412 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-216ENST00000544179 DHODHQ02127 395 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 BAMBIQ13145 260 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 MED21Q13503 144 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 GPR50Q13585 617 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 DPYSL3Q14195 570 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TRIP10Q15642 601 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PTPN20Q4JDL3 420 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ZNF544Q6NX49 715 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SLC39A4Q6P5W5 647 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CYHR1Q6ZMK1 362 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 Q6ZVQ6 151 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 LYG2Q86SG7 212 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TMEM126BQ8IUX1 230 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 NAXDQ8IW45 347 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 IFT20Q8IY31 132 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 MFSD9Q8NBP5 474 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PIGCQ92535 297 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 LHX4Q969G2 390 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 GLYATL1Q969I3 302 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 MCHR2Q969V1 340 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 BIRC7Q96CA5 298 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TMEM80Q96HE8 168 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ZNF597Q96LX8 424 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SERPINB11Q96P15 392 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SLC38A2Q96QD8 506 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ACCSQ96QU6 501 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ERVK-6Q9BXR3 956 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 FTHL17Q9BXU8 183 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 UCK2Q9BZX2 261 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PARLQ9H300 379 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 C1orf198Q9H425 327 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 RGS18Q9NS28 235 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 VAPAQ9P0L0 249 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 MLXQ9UH92 298 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 FOXJ3Q9UPW0 622 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ZNF337Q9Y3M9 751 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ALG6Q9Y672 507 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 RGS12O14924 1447 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 LRRC7Q96NW7 1537 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 A0A1B0GVL5 298 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SH3PXD2BA1X283 911 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 A8MU76 341 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 E7EWF7 191 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ANHXE9PGG2 379 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 M0QXV9 152 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PDHXO00330 501 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 RFXANKO14593 260 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 P2RX6O15547 441 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PRKYO43930 277 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ENTPD5O75356 428 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 OR7A10O76100 309 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PSMG1O95456 288 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CTDNEP1O95476 244 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TSPAN12O95859 305 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TXNDC12O95881 172 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TCRBP04435 133 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PROS1P07225 676 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 NCK1P16333 377 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PGAM1P18669 254 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 MMP11P24347 488 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PRDX2P32119 198 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 GPR183P32249 361 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 KDELR2P33947 212 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PCK1P35558 622 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ACVR1BP36896 505 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CFHR2P36980 270 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 COILP38432 576 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 YAP1P46937 504 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 UQCRFS1P47985 274 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 NPBWR2P48146 333 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 UCNP55089 124 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PPIAP62937 165 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 BST2Q10589 180 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CNTN1Q12860 1018 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 MESDQ14696 234 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 POU6F1Q14863 301 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 GPNMBQ14956 572 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 P2RY14Q15391 338 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 KCNJ8Q15842 424 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 QRICH1Q2TAL8 776 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 DEFB115Q30KQ5 88 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms