RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 ENTPD1P49961 510 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 ST3GAL4Q11206 333 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM27BQ5VT28 67 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC16A14Q7RTX9 510 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 OR52N5Q8NH56 324 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 NPR2P20594 1047 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 IL32P24001 234 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 CD79BP40259 229 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 TGFBR3Q03167 851 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 SSX6Q7RTT6 188 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC35F2Q8IXU6 374 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 MARCH7Q9H992 704 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 PRR32B1ATL7 298 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 AGFG2O95081 481 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 CD79AP11912 226 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 CXCR4P61073 352 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 CFAP77Q6ZQR2 320 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC16A9Q7RTY1 509 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 COPS4Q9BT78 406 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 SCN3BQ9NY72 215 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 HRGP04196 525 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 UGT2B10P36537 528 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 ASCL1P50553 236 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 CHN2P52757 468 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 BLVRAP53004 296 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNMB1Q16558 191 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF627Q7L945 461 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 DCXRQ7Z4W1 244 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 LHFPL3Q86UP9 236 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR31Q8NA23 367 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 THEM6Q8WUY1 208 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 ACTR6Q9GZN1 396 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNJ16Q9NPI9 418 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 C12orf71A8MTZ7 269 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 J3QRE1 110 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 FARS2O95363 451 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC159P0C7I6 412 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF32P17041 273 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC35A2P78381 396 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB40BQ12829 278 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC18B1Q6NT16 456 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 CDC20BQ86Y33 519 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP6Q96JE9 813 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 FKBP14Q9NWM8 211 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 CLEC2DQ9UHP7 191 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 TMED1Q13445 227 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 STX19Q8N4C7 294 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 AKR7LQ8NHP1 331 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 ELOVL5Q9NYP7 299 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 TPRKBQ9Y3C4 175 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 C16orf97H3BN30 126 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 RPSAP08865 295 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 HTR1AP08908 422 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 LSM6P62312 80 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL22Q53GT1 634 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 OTOSQ8NHW6 89 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC90BQ9GZT6 254 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 DUSP21Q9H596 190 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF121Q9H920 327 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 LAMP5Q9UJQ1 280 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 EFCAB10A6NFE3 127 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 FADS2O95864 444 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 CST2P09228 141 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 ETV1P50549 477 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF85Q03923 595 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 PCK2Q16822 640 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF774Q6NX45 483 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 OR10S1Q8NGN2 331 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 ABHD6Q9BV23 337 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC17A5Q9NRA2 495 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 CLDN14O95500 239 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 ALOX5APP20292 161 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 PSG4Q00888 419 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 TFF3Q07654 80 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 POU4F2Q12837 409 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 OR7E24Q6IFN5 339 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 XKRXQ6PP77 449 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 MDP1Q86V88 176 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC7A6Q92536 515 aa19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms