RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 IQCF1Q8N6M8 205 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF525Q8N782 197 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 TRIML2Q8N7C3 387 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF540Q8NDQ6 660 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 OR4A15Q8NGL6 344 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 OR52N5Q8NH56 324 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF563Q8TA94 476 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 AGR3Q8TD06 166 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 TCP10LQ8TDR4 215 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 ARL5BQ96KC2 179 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC115Q96NT0 180 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 BEX2Q9BXY8 128 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 OR51I1Q9H343 314 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 CYSLTR2Q9NS75 346 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 SLC17A7Q9P2U7 560 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 BTNL2Q9UIR0 455 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 HAO1Q9UJM8 370 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 CFAP73A6NFT4 308 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 C9JVG2 144 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 E9PBE3 544 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 M0R1B8 84 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 HMGN4O00479 90 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 BIRC5O15392 142 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 GPRIN2O60269 458 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 SERPINE1P05121 402 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 GPIP06744 558 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 OR12D1P0DN82 309 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 PPOXP50336 477 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 PDLIM4P50479 330 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 FABP6P51161 128 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 PRPS1P60891 318 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 EFNB3Q15768 340 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 FAM166AQ6J272 317 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 CLECL1Q8IZS7 167 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 WDR31Q8NA23 367 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 SLC35B4Q969S0 331 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM109Q9BVC6 243 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 NUF2Q9BZD4 464 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 DPY30Q9C005 99 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 SLC7A10Q9NS82 523 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF69Q9UC07 566 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 OSGIN1Q9UJX0 560 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 KCNS2Q9ULS6 477 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-222ENST00000514552 LIPT2A6NK58 231 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 TM9SF1O15321 606 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 LMX1BO60663 402 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 NDUFB4O95168 129 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 IGHV3-9P01782 118 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 CRYAAP02489 173 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 EDN2P20800 178 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 GIFP27352 417 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 CHATP28329 748 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 IDH2P48735 452 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 OR2B6P58173 313 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 IFFO1Q0D2I5 559 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 EPS8Q12929 822 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 SQLEQ14534 574 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 LIN52Q52LA3 116 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 GPAT3Q53EU6 434 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 TSPO2Q5TGU0 170 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 UGT2A3Q6UWM9 527 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 C5orf46Q6UWT4 87 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD46Q86W74 232 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 NUP37Q8NFH4 326 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 OR4F15Q8NGB8 312 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 OR52E4Q8NGH9 312 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF479Q96JC4 524 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 SLC38A2Q96QD8 506 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 KCNS3Q9BQ31 491 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 SLC35A5Q9BS91 424 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 LINC00470Q9BZP3 86 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 OR11A1Q9GZK7 315 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 SLC38A1Q9H2H9 487 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF442Q9H7R0 627 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms