RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512656.1

USP46-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 3

Gene USP46, Length 467 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-208ENST00000512656 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 RAB1CQ92928 201 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 YIPF5Q969M3 257 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 MCHR2Q969V1 340 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 SH3GL1Q99961 368 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 SIAEQ9HAT2 523 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 MRGBPQ9NV56 204 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 BAG5Q9UL15 447 aa6.13□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 A0A0G2JMP0 313 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 A0A0X1KG70 313 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 PLSCR5A0PG75 271 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 FAM157AC9JC47 383 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 CLDN25C9JDP6 229 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 TRIM77I1YAP6 450 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 J3QLI3 93 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 CDC14BO60729 498 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 RP2O75695 350 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 NCR1O76036 304 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 LYPD3O95274 346 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 CLPTM1O96005 669 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 IFNA14P01570 189 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 IGHV3-13P01766 116 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 MT-ND1P03886 318 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 THRBP10828 461 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 CCL2P13500 99 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 ACADSP16219 412 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 FUT1P19526 365 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 GCH1P30793 250 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 IFNA8P32881 189 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 CRYBB2P43320 205 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 MAGEB1P43366 347 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 ZNF81P51508 661 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 TAS2R41P59536 307 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 ACTG1P63261 375 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 CCL8P80075 99 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 SLC3A1Q07837 685 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 TAF11Q15544 211 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 HIST3H3Q16695 136 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 HFEQ30201 348 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 C10orf128Q5T292 105 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 ARL9Q6T311 187 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 USP43Q70EL4 1123 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 CCDC80Q76M96 950 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 CARM1Q86X55 608 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 SYT14Q8NB59 555 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 OR10A6Q8NH74 314 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 FNDC8Q8TC99 324 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 TAMM41Q96BW9 452 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 SGTBQ96EQ0 304 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 OR51B6Q9H340 312 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 NANOGQ9H9S0 305 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 INIPQ9NRY2 104 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 H3BSA7 217 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 OR7A10O76100 309 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 OR5F1O95221 314 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 VENTXO95231 258 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 MPZL1O95297 269 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 NPPAP01160 153 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 THY1P04216 161 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
USP46-208ENST00000512656 CCNOP22674 350 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.7 ms