RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498694.1

CTPS1-212, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 599 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-212ENST00000498694 AQP4P55087 323 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CASP6P55212 293 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CTXN1P60606 82 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ESRRGP62508 458 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SIRPAP78324 504 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CDK5Q00535 292 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RUNX1T1Q06455 604 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SLC34A1Q06495 639 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TFF3Q07654 80 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 FOXF2Q12947 444 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PMS2P3Q13401 168 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.841e-10■■□□□ 12.3
CTPS1-212ENST00000498694 CDSNQ15517 529 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 STK11Q15831 433 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ACKR1Q16570 336 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 HIST3H3Q16695 136 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 C10orf128Q5T292 105 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 LPCAT4Q643R3 524 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 GPR139Q6DWJ6 353 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 MTFR2Q6P444 385 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 LINGO2Q7L985 606 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 MRGPRGQ86SM5 289 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 UEVLDQ8IX04 471 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TUSC5Q8IXB3 177 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 LNX2Q8N448 690 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ACBD4Q8NC06 268 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OR2T33Q8NG76 320 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OR52L1Q8NGH7 329 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OR51A7Q8NH64 312 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OR6X1Q8NH79 312 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 EME1Q96AY2 570 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RASD2Q96D21 266 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 BOD1Q96IK1 185 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SAMD8Q96LT4 415 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OXGR1Q96P68 337 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SLC29A1Q99808 456 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ALG12Q9BV10 488 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 LINC00470Q9BZP3 86 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 UCK2Q9BZX2 261 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RACGAP1Q9H0H5 632 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ENKD1Q9H0I2 346 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TXNIPQ9H3M7 391 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 JKAMPQ9P055 326 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 BAIAP2Q9UQB8 552 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OSGIN2Q9Y236 505 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CREBBPQ92793 2442 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CACNA1CQ13936 2221 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 A0A087WWL8 130 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 A0A1B0GUH1 482 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 A0A1W2PPH5 198 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 A0A1W2PRG6 482 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PRSS37A4D1T9 235 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CCDC182A6NF36 153 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 A6NIZ1 184 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OR6C65A6NJZ3 312 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 HSPB2A8KAH6 182 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 H0YJX3 145 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 H7C1C5 153 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 M0R129 80 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 IMPA2O14732 288 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SURF4O15260 269 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RNF13O43567 381 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZG16O60844 167 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms