RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 TNFRSF1AP19438 455 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 TNFSF4P23510 183 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 RBMXP38159 391 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 PSG4Q00888 419 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 ZMYND11Q15326 602 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 SGCAQ16586 387 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 KIR3DL3Q8N743 410 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 OR6T1Q8NGN1 323 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 OR4F5Q8NH21 305 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 ASB10Q8WXI3 467 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 SAMD8Q96LT4 415 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 NANOGQ9H9S0 305 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 VAPAQ9P0L0 249 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 IL20RAQ9UHF4 553 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 SLC7A7Q9UM01 511 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 CORO2BQ9UQ03 480 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 ANGPT4Q9Y264 503 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 GMEB1Q9Y692 573 aa17.5■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 DOCK11Q5JSL3 2073 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 LYPD3O95274 346 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 SLC2A10O95528 541 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 PLATP00750 562 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 THY1P04216 161 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 F13BP05160 661 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 CRYBA1P05813 215 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 GPX2P18283 190 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 MDH2P40926 338 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 DAP3P51398 398 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 ARHGDIAP52565 204 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 ERVK-25P63136 954 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 NPTX1Q15818 432 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 BTNL3Q6UXE8 466 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 LRRN1Q6UXK5 716 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 NABP1Q96AH0 204 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 UPRTQ96BW1 309 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 MPP4Q96JB8 637 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 PKP2Q99959 881 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 MMP27Q9H306 513 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 SMURF2Q9HAU4 748 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 ELOVL3Q9HB03 270 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 LRCH1Q9Y2L9 728 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa17.49■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 TRAPPC13A5PLN9 417 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 FAM181BA6NEQ2 426 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 EVPLLA8MZ36 301 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 M0QZ24 198 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 ICMTO60725 284 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 UGT2B15P54855 530 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 PSG7Q13046 419 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 TAF11Q15544 211 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 DUSP7Q16829 419 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 BRICD5Q6PL45 260 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 OR2Z1Q8NG97 314 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 ZDHHC16Q969W1 377 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 ZNF426Q9BUY5 554 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 OR2H1Q9GZK4 316 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 IKZF5Q9H5V7 419 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 MRGBPQ9NV56 204 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa17.48■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 TRAV40A0A0B4J280 105 aa17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 VIMP08670 466 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 RAG2P55895 527 aa17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 FAM27BQ5VT28 67 aa17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 ARL9Q6T311 187 aa17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 NSMAFQ92636 917 aa17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 C4orf45Q96LM5 186 aa17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 SIGLEC11Q96RL6 698 aa17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 CITED1Q99966 193 aa17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 WNT5BQ9H1J7 359 aa17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 RABEP2Q9H5N1 569 aa17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 INIPQ9NRY2 104 aa17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa17.47■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 CEACAM18A8MTB9 384 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 M0QX08 132 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 TIMM23O14925 209 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 OPN1SWP03999 348 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 WNT2P09544 360 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 CPT2P23786 658 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 PAX2Q02962 417 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 FMODQ06828 376 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 CD47Q08722 323 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 PAGE3Q5JUK9 113 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 METTL21CQ5VZV1 264 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 OLFML2AQ68BL7 652 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 GPR32P1Q8NGA4 272 aa17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
NELFE-210ENST00000491139 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms