RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 NGFP01138 241 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 CRYBB2P43320 205 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 GDI2P50395 445 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 FXYD6P3P58550 94 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 SNX33Q8WV41 574 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 FAM162AQ96A26 154 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 FUZQ9BT04 418 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 OR2J1Q9GZK6 312 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 TREM2Q9NZC2 230 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 CACNG2Q9Y698 323 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PPL8 197 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PRQ8 180 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 TFP02787 698 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 GAAP10253 952 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 MSR1P21757 451 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 DGCR6Q14129 220 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 SYT9Q86SS6 491 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 EMC7Q9NPA0 242 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 EGFL7Q9UHF1 273 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL21Q9UJP4 597 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 SIGLEC7Q9Y286 467 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 NDUFAB1O14561 156 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV1-46P01743 117 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 OMPP47874 163 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 SEC23BQ15437 767 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF718Q3SXZ3 478 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 THSD4Q6ZMP0 1018 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 DHRS1Q96LJ7 313 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 PRSS37A4D1T9 235 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 IMPA2O14732 288 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 H1F0P07305 194 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 CTLA4P16410 223 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 PCBD1P61457 104 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 CMTM5Q96DZ9 223 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 NRIP3Q9NQ35 241 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 GRHPRQ9UBQ7 328 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM5Q9Y2B1 443 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 AHCYL1O43865 530 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 MSMBP08118 114 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 ADH4P08319 380 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 RHCEP18577 417 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 PRDX6P30041 224 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 RPL4P36578 427 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF81P51508 661 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1CBP62140 327 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 MOGQ16653 247 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 TSTQ16762 297 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 GLYATQ6IB77 296 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 USP51Q70EK9 711 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 CYP4Z1Q86W10 505 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 ABHD4Q8TB40 342 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM186Q96B77 213 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 RASD2Q96D21 266 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF570Q96NI8 536 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 GPA33Q99795 319 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 C19orf24Q9BVV8 132 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 POFUT1Q9H488 388 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 SPAG4Q9NPE6 437 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 RPS6KA6Q9UK32 745 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 C12orf71A8MTZ7 269 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 H3BSA7 217 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 SEMG1P04279 462 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 DRD4P21917 467 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 SPRNQ5BIV9 151 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 FAM209AQ5JX71 171 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 AVPI1Q5T686 147 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 GLCCI1Q86VQ1 547 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf174Q8IYL3 243 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 C4orf45Q96LM5 186 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 WACQ9BTA9 647 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 HIF1ANQ9NWT6 349 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 SNX3O60493 162 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 DIRAS1O95057 198 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 COX5BP10606 129 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 GCH1P30793 250 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 OTPQ5XKR4 325 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 RINLQ6ZS11 566 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 PTCHD4Q6ZW05 846 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 RNF148Q8N7C7 305 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 SAP30LQ9HAJ7 183 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 LPAR2Q9HBW0 351 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 UBOX5O94941 541 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 NDUFB2O95178 105 aa23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms