RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487008.1

RAB17-211, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB17, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-211	ENST00000487008	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	CDH20	Q9HBT6	801 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	B9D1	Q9UPM9	204 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	FKBP7	Q9Y680	259 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	F8	P00451	2351 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008		B9A039	149 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008		H3BN98	237 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008		H7C417	338 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	FCGR1A	P12314	374 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	ANXA8	P13928	327 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	STOM	P27105	288 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	GLRX	P35754	106 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	CENPA	P49450	140 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	GLO1	Q04760	184 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	ATP6AP1	Q15904	470 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	KCNMB1	Q16558	191 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	OR6V1	Q8N148	313 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	MPZL1	O95297	269 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	GAA	P10253	952 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	CCL2	P13500	99 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	PRKACG	P22612	351 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	FAS	P25445	335 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	AQP6	Q13520	282 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	BDH2	Q9BUT1	245 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	FN3K	Q9H479	309 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	CMAHP	Q9Y471	501 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	GPRIN2	O60269	458 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	IFNG	P01579	166 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	OSM	P13725	252 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	PCSK6	P29122	969 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	ACTR3	P61158	418 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF774	Q6NX45	483 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	OR2T4	Q8NH00	348 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	DDO	Q99489	341 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	PLK3	Q9H4B4	646 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	C5orf49	A4QMS7	147 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	SGCE	O43556	437 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	NDUFS7	O75251	213 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	GPANK1	O95872	356 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	FAM157B	P0CG42	384 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	COX5B	P10606	129 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF3	P17036	446 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	CCNO	P22674	350 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	GRK5	P34947	590 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	RAD52	P43351	418 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	CRMP1	Q14194	572 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	RAB35	Q15286	201 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	OTP	Q5XKR4	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	SVOPL	Q8N434	492 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB17-211	ENST00000487008	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21

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