RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467308.1

TSSC4-208, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 4, human

TSL 3

Gene TSSC4, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSSC4-208	ENST00000467308	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	FANK1	Q8TC84	345 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	CYGB	Q8WWM9	190 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SNX18	Q96RF0	628 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	DOK1	Q99704	481 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	NDUFB2	O95178	105 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	HIST1H2AB	P04908	130 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	NPR2	P20594	1047 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	MYF6	P23409	242 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	CALCR	P30988	508 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	GGT2	P36268	569 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	P2RY4	P51582	365 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ZP4	Q12836	540 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	RIN1	Q13671	783 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	C12orf73	Q69YU5	71 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	OR5J2	Q8NH18	312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ASPN	Q9BXN1	380 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	OR52D1	Q9H346	318 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	METRN	Q9UJH8	293 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	LRRN3	E7EW58	273 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308		H3BN98	237 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	BHLHE40	O14503	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	IDH3B	O43837	385 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SOX14	O95416	240 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	GRPR	P30550	384 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC6A6	P31641	620 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SELENOP	P49908	381 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	HGFAC	Q04756	655 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	LGALS3BP	Q08380	585 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF691	Q5VV52	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	LINGO2	Q7L985	606 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	LNX2	Q8N448	690 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SETD9	Q8NE22	299 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	OR2T33	Q8NG76	320 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	OR51A7	Q8NH64	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	APOL4	Q9BPW4	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TEX12	Q9BXU0	123 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	NELFA	Q9H3P2	528 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A096LPE4	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A1W2PPZ6	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM129	A0AVI4	362 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308		B4DSR2	109 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	PLPP3	O14495	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ARPC3	O15145	178 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	UPK3A	O75631	287 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	HMGN1	P05114	100 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	GNAO1	P09471	354 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	IFNGR1	P15260	489 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	CBR1	P16152	277 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	POU1F1	P28069	291 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	GRK5	P34947	590 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	THBS4	P35443	961 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	CDC42	P60953	191 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TUBA1B	P68363	451 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TUBA4A	P68366	448 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	EFNB1	P98172	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	MED21	Q13503	144 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	GINS1	Q14691	196 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	NIPAL3	Q6P499	406 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TUBA1A	Q71U36	451 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24

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