RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 DHRS1Q96LJ7 313 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 FUZQ9BT04 418 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 SYT4Q9H2B2 425 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 GORASP2Q9H8Y8 452 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 POLE4Q9NR33 117 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 AURKCQ9UQB9 309 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 TMEM5Q9Y2B1 443 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 UNC119BA6NIH7 251 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 XKRYO14609 159 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 WNT9BO14905 357 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 LMX1BO60663 402 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 DCTN3O75935 186 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 GADD45GO95257 159 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 MPZL1O95297 269 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 PPP1R3DO95685 299 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 NGFP01138 241 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 CST2P09228 141 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 ZNF250P15622 560 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 ATP6V1B2P21281 511 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 MSR1P21757 451 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 RAD52P43351 418 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 KRT72Q14CN4 511 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 FAM166AQ6J272 317 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 CYP2R1Q6VVX0 501 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 ABHD4Q8TB40 342 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 SLC25A40Q8TBP6 338 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 C11orf40Q8WZ69 217 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 NSMCE2Q96MF7 247 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 NRIP3Q9NQ35 241 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 PRSS37A4D1T9 235 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 SLC16A7O60669 478 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 CDC14BO60729 498 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 TACSTD2P09758 323 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 SDHAP31040 664 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 RRM2P31350 389 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 CCL8P80075 99 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 TSTQ16762 297 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 C16orf89Q6UX73 402 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 ZER1Q7Z7L7 766 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 FITM2Q8N6M3 262 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 FANK1Q8TC84 345 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 FNDC8Q8TC99 324 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 SNX33Q8WV41 574 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 SLC7A6Q92536 515 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 TSSK2Q96PF2 358 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 OR2J1Q9GZK6 312 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 POFUT1Q9H488 388 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 C17orf100A8MU93 164 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 DCTN6O00399 190 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 OR10H3O60404 316 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 DOK2O60496 412 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 TGFAP01135 160 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 FABP3P05413 133 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 RBMXP38159 391 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 CHN2P52757 468 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 MEP1BQ16820 701 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 ZNF540Q8NDQ6 660 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 RDH5Q92781 318 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 CCT8L2Q96SF2 557 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 BEX2Q9BXY8 128 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 NUAK2Q9H093 628 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 SHARPINQ9H0F6 387 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 FN3KQ9H479 309 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 CACNG2Q9Y698 323 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 RP2O75695 350 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 ITGA2P17301 1181 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 ACHEP22303 614 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 GCH1P30793 250 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 HTR5AP47898 357 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 SELENOVP59797 346 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 FAM120AOSQ5T036 256 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 AVPI1Q5T686 147 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 TMEM154Q6P9G4 183 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 SMARCD3Q6STE5 483 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-209ENST00000439106 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms