RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 ERLIN1O75477 346 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 GPANK1O95872 356 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 TNFRSF1AP19438 455 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 FUT1P19526 365 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 OMGP23515 440 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 AQP2P41181 271 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC18A1P54219 525 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 ERVK-25P63136 954 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 PAX2Q02962 417 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 PSG7Q13046 419 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 ESCO2Q56NI9 601 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 DLEU7Q6UYE1 221 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 CROCCP2Q86T23 111 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 PARP8Q8N3A8 854 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 UPRTQ96BW1 309 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 C4orf45Q96LM5 186 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 SIGLEC11Q96RL6 698 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 ELOVL3Q9HB03 270 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 OR5V1Q9UGF6 321 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 IL20RAQ9UHF4 553 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 USH1CQ9Y6N9 552 aa12.53□□□□□ -0.4
ACTBP11-201ENST00000436287 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 NPIPB13A6NJU9 1138 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 NPIPB4C9JG80 1138 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 OR7A10O76100 309 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 PLATP00750 562 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 MT-ND1P03886 318 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 WNT2P09544 360 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 TSPAN19P0C672 248 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 CD247P20963 164 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 TNFSF4P23510 183 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 CPT2P23786 658 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 PCGF2P35227 344 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 MDH2P40926 338 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 ARHGDIAP52565 204 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 FMODQ06828 376 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 RUNDC3AQ59EK9 446 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 SPATC1Q76KD6 591 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 JAZF1Q86VZ6 243 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 NSMAFQ92636 917 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 PRDM13Q9H4Q3 707 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 NANOGQ9H9S0 305 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 ARMCX1Q9P291 453 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa12.52□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 GMNCA6NCL1 334 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 CEACAM18A8MTB9 384 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM178BH3BS89 294 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 KNG1P01042 644 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 IGF2P01344 180 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 VIMP08670 466 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 CST2P09228 141 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 NR2C1P13056 603 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 TUBG1P23258 451 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 LAP3P28838 519 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 PCBD1P61457 104 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 CD47Q08722 323 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 TAF11Q15544 211 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF774Q6NX45 483 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 ARL9Q6T311 187 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 LRRN1Q6UXK5 716 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 Q6ZR03 302 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 OR2Z1Q8NG97 314 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 MOSPD2Q8NHP6 518 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 WFDC12Q8WWY7 111 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 LIPHQ8WWY8 451 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 BEX1Q9HBH7 125 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 TUBG2Q9NRH3 451 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 TBCCD1Q9NVR7 557 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 IL19Q9UHD0 177 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 LRCH1Q9Y2L9 728 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 CMYA5Q8N3K9 4069 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 SURF4O15260 269 aa12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 TGDSO95455 350 aa12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 KITLGP21583 273 aa12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 RBM34P42696 430 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 IDH3AP50213 366 aa12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 LAPTM4AQ15012 233 aa12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 CYP51A1Q16850 503 aa12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 AGKQ53H12 422 aa12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 BTNL3Q6UXE8 466 aa12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 C17orf107Q6ZR85 190 aa12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 KIR3DL3Q8N743 410 aa12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 PFN4Q8NHR9 129 aa12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 ITLN1Q8WWA0 313 aa12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 RAB40AQ8WXH6 277 aa12.5□□□□□ -0.41
ACTBP11-201ENST00000436287 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms