RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 DUXAA6NLW8 204 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 GJE1A6NN92 205 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 GOLGA8NF8WBI6 632 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 GOLGA8RI6L899 631 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 UBXN8O00124 270 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 KLF11O14901 512 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 PPIHO43447 177 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 H1F0P07305 194 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 OR4A8P0C604 315 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 COX5AP20674 150 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 PRTN3P24158 256 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 EDNRAP25101 427 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 MAGEA3P43357 314 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 MAGEA6P43360 314 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 MMP15P51511 669 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ARFIP1P53367 373 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 PSPHP78330 225 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ZP4Q12836 540 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 IFT88Q13099 833 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 BAMBIQ13145 260 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 NPTX1Q15818 432 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM44Q2T9K0 475 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CDKL4Q5MAI5 379 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 MORN5Q5VZ52 161 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRK-210ENST00000415055 OR7E24Q6IFN5 339 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 WDR73Q6P4I2 378 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 KLC3Q6P597 504 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 LEG1Q6P5S2 330 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 Q6ZTK2 550 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRK-210ENST00000415055 ADCK1Q86TW2 530 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 COMMD2Q86X83 199 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF786Q8N393 782 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRK-210ENST00000415055 CLDND2Q8NHS1 167 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CDC26Q8NHZ8 85 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 NANPQ8TBE9 248 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 RNF138Q8WVD3 245 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SLC25A28Q96A46 364 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 APH1AQ96BI3 265 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SGK494Q96LW2 274 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 VSTM2LQ96N03 204 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM237Q96Q45 408 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 NAT9Q9BTE0 207 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 FAIM2Q9BWQ8 316 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SLITRK2Q9H156 845 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 NTN4Q9HB63 628 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SLC52A3Q9NQ40 469 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 MED17Q9NVC6 651 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 TAS2R16Q9NYV7 291 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 EMC3Q9P0I2 261 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 RHCGQ9UBD6 479 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CHMP2BQ9UQN3 213 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 RNF11Q9Y3C5 154 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRK-210ENST00000415055 A0A0X1KG70 313 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 A0A1W2PPW3 197 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 H0YIV9 168 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF195O14628 629 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 RGS14O43566 566 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SERPINI2O75830 405 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SEMA3DO95025 777 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 MPZL1O95297 269 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRK-210ENST00000415055 ADRA2AP08913 450 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 GFAPP14136 432 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ANPEPP15144 967 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CD1DP15813 335 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CBLP22681 906 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 GABRA3P34903 492 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ELK3P41970 407 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 NPBWR1P48145 328 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 PPOXP50336 477 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CCNG1P51959 295 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ATP6V0D1P61421 351 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 MYBPC1Q00872 1141 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 TGFBR3Q03167 851 aa3.84□□□□□ -1.79
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