RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 CLEC2DQ9UHP7 191 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GNG8Q9UK08 70 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MGAQ8IWI9 3026 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 DNAJC13O75165 2243 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CCL21O00585 134 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 DVL2O14641 736 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 NOL3O60936 208 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TOXO94900 526 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PTHP01270 115 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 LCKP06239 509 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CST2P09228 141 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 H2BFMP0C1H6 154 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 LIMS3P0CW19 117 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 LIMS4P0CW20 117 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 B4GALT1P15291 398 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ALOX5APP20292 161 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TTKP33981 857 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CA7P43166 264 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TAS2R43P59537 309 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ARF1P84077 181 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 AQP6Q13520 282 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TIGD6Q17RP2 521 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SLC36A2Q495M3 483 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 OR2G6Q5TZ20 316 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2UQ5VVX9 321 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 OTPQ5XKR4 325 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ANKRD16Q6P6B7 361 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 KLHL24Q6TFL4 600 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZT83 130 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 LINGO2Q7L985 606 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 BTLAQ7Z6A9 289 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SYS1Q8N2H4 156 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GJC3Q8NFK1 279 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GATAD2BQ8WXI9 593 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF416Q9BWM5 594 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM36Q9NQ86 728 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CENPMQ9NSP4 180 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GALNT8Q9NY28 637 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 COPS3Q9UNS2 423 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 LOC400499M0QZD8 3231 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 METTL15A6NJ78 407 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF878C9JN71 531 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TNFSF13O75888 250 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 IL18BPO95998 194 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SCG5P05408 212 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CD8BP10966 210 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 EDNRAP25101 427 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 HSD11B1P28845 292 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 RIDAP52758 137 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SCRN3Q0VDG4 424 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GTF3C1Q12789 2109 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CDONQ4KMG0 1287 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TP53I3Q53FA7 332 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ARMCX4Q5H9R4 360 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 FAM27BQ5VT28 67 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 XAF1Q6GPH4 301 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM53Q6P2H8 277 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CORO6Q6QEF8 472 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SPATC1Q76KD6 591 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SSX6Q7RTT6 188 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 DPPA2Q7Z7J5 298 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SYT9Q86SS6 491 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MED12LQ86YW9 2145 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF610Q8N9Z0 462 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 HTRA1Q92743 480 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 UFD1Q92890 307 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MUL1Q969V5 352 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 NABP1Q96AH0 204 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 STARD4Q96DR4 205 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SLAMF6Q96DU3 332 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 DOCK7Q96N67 2140 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 OR5M11Q96RB7 305 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 OR8B4Q96RC9 309 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MGLLQ99685 303 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SH3GL3Q99963 347 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ABHD6Q9BV23 337 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ISYNA1Q9NPH2 558 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 COQ3Q9NZJ6 369 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ASH2LQ9UBL3 628 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MEMO1Q9Y316 297 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 A0A096LPE4 126 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0G2JNJ9 132 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PPZ6 126 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC160A6NGH7 325 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PSMD9O00233 223 aa10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms