RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365541.1

RNA5SP259-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 259, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP259, Length 109 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP259-201ENST00000365541 SUPT3HB4E1H0 165 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 SMKR1H3BMG3 65 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ERI3O43414 337 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CCNB2O95067 398 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 LCA5LO95447 670 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 LSM8O95777 96 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CLIC3O95833 236 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 MOSP00540 346 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ARG1P05089 322 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CRYGCP07315 174 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 POLR2MP0CAP2 368 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 DUX4L4P0CJ87 422 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 FOLR1P15328 257 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ZNF250P15622 560 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CD1EP15812 388 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ZNF19P17023 458 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ZNF30P17039 623 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CTRB1P17538 263 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CD82P27701 267 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 BTCP35070 178 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 RDXP35241 583 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 DRD3P35462 400 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 RPS5P46782 204 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 LHX2P50458 406 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CCNG1P51959 295 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CRISP3P54108 245 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 SYNJ2BPP57105 145 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ACTA2P62736 377 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ACTG2P63267 376 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ACTC1P68032 377 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ACTA1P68133 377 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 SLC7A9P82251 487 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CDH17Q12864 832 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 KIR2DS1Q14954 304 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 STK38Q15208 465 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 IRF4Q15306 451 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 GUCA2BQ16661 112 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 HADHQ16836 314 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 TMEM183BQ1AE95 376 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 RPEL1Q2QD12 228 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ALKBH6Q3KRA9 238 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ZBED5Q49AG3 693 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 C2orf83Q53S99 150 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 PPM1LQ5SGD2 360 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 AVPI1Q5T686 147 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CYB5R2Q6BCY4 276 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 OR52W1Q6IF63 320 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 LCN12Q6JVE5 192 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 WDR82Q6UXN9 313 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 C19orf35Q6ZS72 473 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 SLC35D2Q76EJ3 337 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 FAM122BQ7Z309 247 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 VTCN1Q7Z7D3 282 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 LINC00523Q86TU6 105 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 LINC01551Q86U37 167 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 OAFQ86UD1 273 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 PCP2Q8IVA1 136 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 TMEM183AQ8IXX5 376 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 NPWQ8N729 165 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 PROKR2Q8NFJ6 384 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 OR10G6Q8NH81 332 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ITFG1Q8TB96 612 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 MITD1Q8WV92 249 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 RNF138Q8WVD3 245 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CAPSLQ8WWF8 208 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 TMEM230Q96A57 120 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 NTAN1Q96AB6 310 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 MRGPRFQ96AM1 343 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 FAM3DQ96BQ1 224 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 BTN2A3PQ96KV6 586 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 TEAD3Q99594 435 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 UCK2Q9BZX2 261 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 TOLLIPQ9H0E2 274 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 DEFB129Q9H1M3 183 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CLMPQ9H6B4 373 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 TMEM38AQ9H6F2 299 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa0.99□□□□□ -2.25
RNA5SP259-201ENST00000365541 CHRAC1Q9NRG0 131 aa0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms