RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 BRD7Q9NPI1 651 aa14.16□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.16□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF221Q9UK13 617 aa14.16□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0B4J203 849 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 AKR7A3O95154 331 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 OR6A2O95222 327 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 SP1P08047 785 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM157BP0CG42 384 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 PSKH1P11801 424 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 CD46P15529 392 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR85P60893 370 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 GALK2Q01415 458 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 OR10G3Q8NGC4 313 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM234Q8WY98 164 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 RFT1Q96AA3 541 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP6Q96JE9 813 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 C5orf34Q96MH7 638 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 ABHD1Q96SE0 405 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 C2orf72A6NCS6 295 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 PLPP3O14495 311 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 LANCL1O43813 399 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 C1QL1O75973 258 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 ABHD16AO95870 558 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXO45P0C2W1 286 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 ALOX5APP20292 161 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 MAGEB1P43366 347 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 C17orf67Q0P5P2 114 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 ACKR1Q16570 336 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 THEM6Q8WUY1 208 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 HSD17B8Q92506 261 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 INTS14Q96SY0 518 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 FRRS1LQ9P0K9 344 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 NLKQ9UBE8 527 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 B9D1Q9UPM9 204 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa14.15□□□□□ -0.14
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0B4J293 547 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 PRSS37A4D1T9 235 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 ACOD1A6NK06 481 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 TTLL8A6PVC2 850 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 PDCD5O14737 125 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 SHOXO15266 292 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2T1O43869 369 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 AHSA1O95433 338 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 GPANK1O95872 356 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 CCL3P10147 92 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 TFPIP10646 304 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 DDOSTP39656 456 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF843Q8N446 348 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF519Q8TB69 540 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 ORAI1Q96D31 301 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 DERL3Q96Q80 235 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 SPATA2Q9UM82 520 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.14□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 HLA-DMAP28067 261 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 PMP22Q01453 160 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 EGR3Q06889 387 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR176Q14439 515 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 NTRK2Q16620 822 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 BICRALQ6AI39 1079 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 C5orf46Q6UWT4 87 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 HGDQ93099 445 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 RELTQ969Z4 430 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 MARVELD3Q96A59 401 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 FKBP7Q9Y680 259 aa14.13□□□□□ -0.15
TSNARE1-201ENST00000307180 ALPK2Q86TB3 2170 aa14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms