RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF160Q9HCG1 818 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 DECR2Q9NUI1 292 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC30A6NM36 301 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 TK1P04183 234 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 CRYBA1P05813 215 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 AKAIN1P0CW23 69 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 CLDN20P56880 219 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 RPS23P62266 143 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 HBG1P69891 147 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 HBG2P69892 147 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 CXADRP78310 365 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 GPLD1P80108 840 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 UBE2NLQ5JXB2 153 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 OR4D11Q8NGI4 311 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 CORO2AQ92828 525 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 OR6C1Q96RD1 312 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 LMF1Q96S06 567 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 ATF6BQ99941 703 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 STARD5Q9NSY2 213 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 UFSP2Q9NUQ7 469 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 CBLCQ9ULV8 474 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 KRBOX1C9JBD0 128 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 IMPA2O14732 288 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 TNFRSF10CO14798 259 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 MOSPD3O75425 235 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 CYB561P49447 251 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 EFNA3P52797 238 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 ADPRHP54922 357 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 FCN2Q15485 313 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM240Q5SV17 173 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 OR4Q3Q8NH05 313 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 ULBP2Q9BZM5 246 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 SLC25A18Q9H1K4 315 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 SLC22A7Q9Y694 548 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 A0A087WV62 115 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 FABP7O15540 132 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 RPL7P18124 248 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 MORN4Q8NDC4 146 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 ZBTB8AQ96BR9 441 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 BOD1Q96IK1 185 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 EMC7Q9NPA0 242 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 LHX6Q9UPM6 363 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 H0Y8G0 127 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 HLA-HP01893 362 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 MT-ND4P03905 459 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 PTGER4P35408 488 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 GZMKP49863 264 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 WBP2NLQ6ICG8 309 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF595Q8IYB9 648 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 FAM109AQ8N4B1 249 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 V9GYH0 126 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 TET1Q8NFU7 2136 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 KLK10O43240 276 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 ALX3O95076 343 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 MT-ND4LP03901 98 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 GSK3AP49840 483 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 ZIC1Q15915 447 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 FAM162BQ5T6X4 162 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM244Q5VVB8 128 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 OR11A1Q9GZK7 315 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 F5H5K5 113 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 DDAH2O95865 285 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF44P15621 663 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 NFYBP25208 207 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 NDUFA6P56556 154 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 TCTE3Q8IZS6 198 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 NT5CQ8TCD5 201 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 PAQR8Q8TEZ7 354 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 HRH4Q9H3N8 390 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 SLC39A9Q9NUM3 307 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 DUSP13Q9UII6 198 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 RAP2BP61225 183 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 RPS18P62269 152 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 CD276Q5ZPR3 534 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 UBE3DQ7Z6J8 389 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 SIAH3Q8IW03 269 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 OR14A16Q8NHC5 309 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 SYNPRQ8TBG9 265 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 KCNE4Q8WWG9 221 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 ARV1Q9H2C2 271 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 RAB18Q9NP72 206 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 RCE1Q9Y256 329 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 SVILO95425 2214 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 RTTNQ86VV8 2226 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 GDNFP39905 211 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRG-201ENST00000295874 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms