RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 BMI1P35226 326 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 RAD52P43351 418 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 CAPZBP47756 277 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 AGBL4Q5VU57 503 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 R4GMQ9 66 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 HMGN4O00479 90 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 RNF4P78317 190 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 HTR4Q13639 388 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TPBGQ13641 420 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 RAB35Q15286 201 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ZNF626Q68DY1 528 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 OR10K2Q6IF99 312 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TMUB2Q71RG4 321 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PIGMQ9H3S5 423 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 LILRA5A6NI73 299 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 AGPAT2O15120 278 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PNLIPRP2P54317 469 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 USP51Q70EK9 711 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 MAVSQ7Z434 540 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 FJX1Q86VR8 437 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PFN4Q8NHR9 129 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 YIPF5Q969M3 257 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 COPS3Q9UNS2 423 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PRRG2O14669 202 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TO15178 435 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 LALBAP00709 142 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 IGLV3-25P01717 112 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PDXPQ96GD0 296 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 VPS25Q9BRG1 176 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ANGPTL7O43827 346 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TPPPO94811 219 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 CXCL10P02778 98 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SRFP11831 508 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 DEFA4P12838 97 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 Q6ZRG5 221 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TDHQ8IZJ6 230 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 RASD2Q96D21 266 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ATF6BQ99941 703 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ADAM19Q9H013 955 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 LAMB2P55268 1798 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 C7orf72A4D263 438 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 B4GAT1O43505 415 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 MT-ND4LP03901 98 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ARRB2P32121 409 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 IRS1P35568 1242 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 RANP62826 216 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 COTL1Q14019 142 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 Q6ZNB5 142 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 MARC2Q969Z3 335 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SEH1LQ96EE3 360 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 MBOAT4Q96T53 435 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ARV1Q9H2C2 271 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.6□□□□□ -1.35
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