RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 KDM8Q8N371 416 aa16.6■□□□□ 0.25
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CLN8-211ENST00000636934 SCMH1Q96GD3 660 aa16.6■□□□□ 0.25
CLN8-211ENST00000636934 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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CLN8-211ENST00000636934 LRP12Q9Y561 859 aa16.6■□□□□ 0.25
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CLN8-211ENST00000636934 RELTQ969Z4 430 aa16.57■□□□□ 0.24
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CLN8-211ENST00000636934 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa16.57■□□□□ 0.24
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CLN8-211ENST00000636934 GLSO94925 669 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CLN8-211ENST00000636934 PNPP00491 289 aa16.56■□□□□ 0.24
CLN8-211ENST00000636934 GSTT2P0CG29 244 aa16.56■□□□□ 0.24
CLN8-211ENST00000636934 FMODQ06828 376 aa16.56■□□□□ 0.24
CLN8-211ENST00000636934 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
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CLN8-211ENST00000636934 TRIM61Q5EBN2 209 aa16.56■□□□□ 0.24
CLN8-211ENST00000636934 TMEM244Q5VVB8 128 aa16.56■□□□□ 0.24
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