RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 SIAH3Q8IW03 269 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 OR1M1Q8NGA1 313 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 SMIM19Q96E16 107 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 BOD1Q96IK1 185 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 JAM3Q9BX67 310 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 NRSN2Q9GZP1 204 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 ASF1BQ9NVP2 202 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 MIA3Q5JRA6 1907 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 PSME4Q14997 1843 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 XRCC2O43543 280 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 SPDEFO95238 335 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 KIR2DL3P43628 341 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 RFX2P48378 723 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 OR51B6Q9H340 312 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 SDHAF2Q9NX18 166 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF225Q9UK10 706 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1W2PPH5 198 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 AGAP14A8MT82 685 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 AIPO00170 330 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 FCMRO60667 390 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 CBR3O75828 277 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 CD160O95971 181 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 CCL11P51671 97 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 GFERP55789 205 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 RAB5BP61020 215 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 PEA15Q15121 130 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 GLYATL3Q5SZD4 288 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 PRELID1Q9Y255 219 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 TRIP11Q15643 1979 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 K7EQS6 105 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 QDPRP09417 244 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF728P0DKX0 622 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 CHRNB1P11230 501 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 DDOSTP39656 456 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 EMP3P54852 163 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 HLA-BQ31612 363 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 Q6ZNX1 250 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 USP51Q70EK9 711 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 OR56B2PQ8NGI1 322 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 A0A087WUJ7 227 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 PRAMEF4O60810 478 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 RGS11O94810 467 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 CTXN2P0C2S0 81 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 MSL3P1P0C860 447 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 DRD3P35462 400 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 SLC25A1P53007 311 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 PLGLAQ15195 96 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 B3GLCTQ6Y288 498 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 ASB13Q8WXK3 278 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 OPALINQ96PE5 141 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 BCO1Q9HAY6 547 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 METAP1P53582 386 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 LIPNQ5VXI9 398 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 DPPA2Q7Z7J5 298 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF546Q86UE3 836 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 OR4N2Q8NGD1 307 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 TSSK2Q96PF2 358 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 ABHD6Q9BV23 337 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 NTN4Q9HB63 628 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 SPACA1Q9HBV2 294 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0B4J2E0 115 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1B0GX12 115 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 NXPH1P58417 271 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 CDK5Q00535 292 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 PLXDC2Q6UX71 529 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 MDGA2Q7Z553 956 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 NOXO1Q8NFA2 376 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 OR52H1Q8NGJ2 320 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 HSD17B8Q92506 261 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-228ENST00000636120 UBE2FQ969M7 185 aa5.88□□□□□ -1.47
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