RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635030.1

SMARCA2-233, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-233	ENST00000635030	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ACER3	Q9NUN7	267 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	DKKL1	Q9UK85	242 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030		A0A1B0GTI1	187 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030		B4DEV8	164 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030		K7ERU9	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	FLRT2	O43155	660 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	OR1F1	O43749	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	MSC	O60682	206 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	OR2J2	O76002	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ZNF432	O94892	652 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	NTSR2	O95665	410 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	HLA-DQB2	P05538	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	SOD3	P08294	240 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	C1S	P09871	688 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	PET100	P0DJ07	73 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ZNF28	P17035	718 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	HLA-G	P17693	338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	OR10J1	P30954	320 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	BRS3	P32247	399 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	CD80	P33681	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ADRA1A	P35348	466 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	SLC11A2	P49281	568 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	SULT1A2	P50226	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	RAB7A	P51149	207 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	EFNA5	P52803	228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	MVD	P53602	400 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	PGGT1B	P53609	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	PRKAG1	P54619	331 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	SCAND1	P57086	179 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	TAS2R38	P59533	333 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	CDK5	Q00535	292 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	NHLH1	Q02575	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	SCAP	Q12770	1279 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	OLIG2	Q13516	323 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	OR5I1	Q13606	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	SHH	Q15465	462 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	TESK1	Q15569	626 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-233	ENST00000635030	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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