RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 OR52J3Q8NH60 311 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 AKR7LQ8NHP1 331 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 SYNPRQ8TBG9 265 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 TAAR3PQ9P1P4 343 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 GPR160Q9UJ42 338 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 AURKCQ9UQB9 309 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 DCTN3O75935 186 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 CD14P08571 375 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 NAT2P11245 290 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ITGA2P17301 1181 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ERVS71-1P61550 626 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 Q96M85 177 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF570Q96NI8 536 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 CDRT15Q96T59 188 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 BCL2L14Q9BZR8 327 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 GORASP2Q9H8Y8 452 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ARL8BQ9NVJ2 186 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 C5orf49A4QMS7 147 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 CLPTM1O96005 669 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF23P17027 643 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 GIFP27352 417 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 GDI2P50395 445 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 PCBD1P61457 104 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 PGAM4Q8N0Y7 254 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 OR1J1Q8NGS3 322 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 PYURFQ96I23 114 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 C7orf34Q96L11 122 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 LRP5LA4QPB2 252 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 NDUFB2O95178 105 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 CST2P09228 141 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 PSG4Q00888 419 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 C16orf89Q6UX73 402 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 PIGWQ7Z7B1 504 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 SNX33Q8WV41 574 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 MCUR1Q96AQ8 359 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 NSMCE2Q96MF7 247 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 BEX2Q9BXY8 128 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 RERGLQ9H628 205 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 CHODLQ9H9P2 273 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 RTTNQ86VV8 2226 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 HSD17B1P14061 328 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 MSR1P21757 451 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 CHN2P52757 468 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 SMIM11AP58511 58 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM166AQ6J272 317 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM154Q6P9G4 183 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 SNX18Q96RF0 628 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2H1Q9GZK4 316 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 NDE1Q9NXR1 346 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 IL20RAQ9UHF4 553 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 KCNS2Q9ULS6 477 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 UNC119BA6NIH7 251 aa24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 C12orf71A8MTZ7 269 aa24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 LMX1BO60663 402 aa24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 IFNA2P01563 188 aa24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 HPXP02790 462 aa24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 SPIBQ01892 262 aa24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 POM121L2Q96KW2 1035 aa24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 SIGLEC7Q9Y286 467 aa24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 ARPC2O15144 300 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF250P15622 560 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 OMPP47874 163 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 GLO1Q04760 184 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 SEC23BQ15437 767 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 MESTQ5EB52 335 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 DEFB107AQ8IZN7 70 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 RDH5Q92781 318 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 RASD2Q96D21 266 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF416Q9BWM5 594 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 SHARPINQ9H0F6 387 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 WNT5BQ9H1J7 359 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 EMC7Q9NPA0 242 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 LOC100509620A0A075B734 347 aa24.83■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 PRSS37A4D1T9 235 aa24.83■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 PTP4A3O75365 173 aa24.83■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 GADD45GO95257 159 aa24.83■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 TGFAP01135 160 aa24.83■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 MT-ND5P03915 603 aa24.83■■□□□ 1.57
SEMA3B-215ENST00000621029 GCH1P30793 250 aa24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms