RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589864.1

TNNI3-208, Transcript of troponin I3, cardiac type, human

TSL 2

Gene TNNI3, Length 525 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	PPP1CB	P62140	327 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	BTG1	P62324	171 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	MTX3	Q5HYI7	312 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF347	Q96SE7	839 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	MCHR1	Q99705	422 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	MSL2	Q9HCI7	577 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	WNT2	P09544	360 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	TNFSF4	P23510	183 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	RAG2	P55895	527 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	PAX2	Q02962	417 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	ZMYND11	Q15326	602 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	C10orf128	Q5T292	105 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	NANOG	Q9H9S0	305 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TNNI3-208	ENST00000589864	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SRRM5	B3KS81	715 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	UBD	O15205	165 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	NDUFA7	O95182	113 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	NGF	P01138	241 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF32	P17041	273 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC6A2	P23975	617 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	PSG4	Q00888	419 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	BRICD5	Q6PL45	260 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ABHD4	Q8TB40	342 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	THAP1	Q9NVV9	213 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	GMEB1	Q9Y692	573 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864		A0A1W2PRG6	482 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TGDS	O95455	350 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ACADS	P16219	412 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	CDA	P32320	146 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ARHGDIA	P52565	204 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	BPIFB3	P59826	476 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	PSG7	Q13046	419 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SCARB2	Q14108	478 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	MPP2	Q14168	576 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	FBLN7	Q53RD9	439 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	C10orf111	Q8N326	155 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	NOX4	Q9NPH5	578 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	C1RL	Q9NZP8	487 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	LYPD3	O95274	346 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	KIT	P10721	976 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	UMPS	P11172	480 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	GPX2	P18283	190 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TUBG1	P23258	451 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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