RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 SEC61A2Q9H9S3 476 aa5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 NOX3Q9HBY0 568 aa5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CRLF2Q9HC73 371 aa5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR35Q9HC97 309 aa5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 EMC3Q9P0I2 261 aa5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 PROCRQ9UNN8 238 aa5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 COPS3Q9UNS2 423 aa5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MGAQ8IWI9 3026 aa5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ZGRF1Q86YA3 2104 aa5.3□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 SVILO95425 2214 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CACNA1BQ00975 2339 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MEGF11A6BM72 1044 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 NKX2-6A6NCS4 301 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR171O14626 319 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 PRODHO43272 600 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 DHHO43323 396 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 IDH3BO43837 385 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 DOK2O60496 412 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 RAD51DO75771 328 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 GLCEO94923 617 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 HTR1AP08908 422 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 SPARCP09486 303 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 GAAP10253 952 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 PAICSP22234 425 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV1-2P23083 117 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ANOS1P23352 680 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CTSSP25774 331 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 LAP3P28838 519 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 OR3A2P47893 321 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A1P53007 311 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 IL18R1Q13478 541 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 OCLNQ16625 522 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST3H3Q16695 136 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 HIKESHIQ53FT3 197 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ADCK1Q86TW2 530 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC26A10Q8NG04 563 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 OR6N2Q8NGY6 317 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2T4Q8NH00 348 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 NABP1Q96AH0 204 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC120Q96HB5 630 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TEAD3Q99594 435 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TM9SF2Q99805 663 aa5.29□□□□□ -1.56
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CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 NELFAQ9H3P2 528 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 Q9H521 79 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRL4Q9HBW9 690 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM38BQ9NVV0 291 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 UPB1Q9UBR1 384 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 RCE1Q9Y256 329 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 EMC9Q9Y3B6 208 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 FKBP7Q9Y680 259 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa5.29□□□□□ -1.56
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CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.29□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 FREM1Q5H8C1 2179 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 C5orf63A6NC05 138 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 C12orf71A8MTZ7 269 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 E9PLN8 166 aa5.28□□□□□ -1.56
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CAPNS1-208ENST00000589162 ZG16O60844 167 aa5.28□□□□□ -1.56
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CAPNS1-208ENST00000589162 FADS2O95864 444 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 IL18BPO95998 194 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 HLA-HP01893 362 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM18P0DKX4 95 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CRHBPP24387 322 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 HTR1FP30939 366 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMP3P35625 211 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMB10P40306 273 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CAPZA2P47755 286 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ETV1P50549 477 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CHN2P52757 468 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CASP6P55212 293 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM8P78325 824 aa5.28□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TEKQ02763 1124 aa5.28□□□□□ -1.56
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