RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570385.1

CTDNEP1-203, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDNEP1, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-203ENST00000570385 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 SIAEQ9HAT2 523 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 MSL2Q9HCI7 577 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.31□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 TMEM89A2RUT3 159 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 WIPF1O43516 503 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 IGHV3-13P01766 116 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 SBK2P0C263 348 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 MMP15P51511 669 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 PPP1CBP62140 327 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 SCGB2A2Q13296 93 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 C10orf128Q5T292 105 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 OTPQ5XKR4 325 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 CCDC80Q76M96 950 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 NANPQ8TBE9 248 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 TPD52L3Q96J77 140 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 SEPHS2Q99611 448 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 ECSITQ9BQ95 431 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 OR2H1Q9GZK4 316 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 ESM1Q9NQ30 184 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 RHCGQ9UBD6 479 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 MED31Q9Y3C7 131 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 A0A1W2PPL8 197 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 H7C1C5 153 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 UBOX5O94941 541 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 OR5F1O95221 314 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 SCG5P05408 212 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 IFI30P13284 250 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 CTXN1P60606 82 aa7.29□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 TAF11Q15544 211 aa7.29□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 CYBRD1Q53TN4 286 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 ALG10Q5BKT4 473 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 OR51A7Q8NH64 312 aa7.29□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 POFUT1Q9H488 388 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 EMC7Q9NPA0 242 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 MMP26Q9NRE1 261 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 OPN4Q9UHM6 478 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 BAG5Q9UL15 447 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 FXYD1O00168 92 aa7.28□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 PRSS23O95084 383 aa7.28□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 MMEL1Q495T6 779 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 AWAT1Q58HT5 328 aa7.28□□□□□ -1.24
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CTDNEP1-203ENST00000570385 FAM27BQ5VT28 67 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 USP43Q70EL4 1123 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 CALHM3Q86XJ0 350 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 ST7LQ8TDW4 575 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 TSPEARQ8WU66 669 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-203ENST00000570385 C10orf82Q8WW14 230 aa7.28□□□□□ -1.24
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