RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 THRBP10828 461 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ZNF32P17041 273 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 EPHA1P21709 976 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 GATA3P23771 443 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ARHGDIAP52565 204 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 HILS1P60008 231 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 PCBD1P61457 104 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 PSG4Q00888 419 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 GLO1Q04760 184 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 SLC3A1Q07837 685 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 CD47Q08722 323 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ST3GAL3Q11203 375 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 TTMPQ5BVD1 217 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 RABL3Q5HYI8 236 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 NANPQ8TBE9 248 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 FNDC8Q8TC99 324 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 C10orf82Q8WW14 230 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ASB10Q8WXI3 467 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 NSMAFQ92636 917 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 LRRC58Q96CX6 371 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 MAGEB18Q96M61 343 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 DIRC2Q96SL1 478 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ALG12Q9BV10 488 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 NPHS2Q9NP85 383 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 MRGBPQ9NV56 204 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.94□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 TMEM89A2RUT3 159 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 FBP2O00757 339 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 SLC2A10O95528 541 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 AVPP01185 164 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 IGHV1-46P01743 117 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 IGHV2-5P01817 119 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 CST2P09228 141 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 TSPAN19P0C672 248 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 TNFRSF1BP20333 461 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 MAKP20794 623 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 FPR2P25090 351 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 OR1E2P47887 323 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 LIMS1P48059 325 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 MMP15P51511 669 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 CRYBA2P53672 197 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 PPP1CBP62140 327 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ERVK-25P63136 954 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ALG10Q5BKT4 473 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ABHD4Q8TB40 342 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 LZICQ8WZA0 190 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 NABP1Q96AH0 204 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ZNF583Q96ND8 569 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 GAL3ST1Q99999 423 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms