RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 NOXO1Q8NFA2 376 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 ARHGDIGQ99819 225 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 MRI1Q9BV20 369 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 KCNN2Q9H2S1 579 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 POFUT1Q9H488 388 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 TMEM106BQ9NUM4 274 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 NOTCH1P46531 2555 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 GDI2P50395 445 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 HIST3H3Q16695 136 aa13.56□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 OR52E2Q8NGJ4 325 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 PFN4Q8NHR9 129 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa13.56□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 A0A0G2JK05 382 aa13.55□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 POM121CA8CG34 1229 aa13.55□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 M0QX08 132 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 FMO6PO60774 539 aa13.55□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 ACADSP16219 412 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 CD80P33681 288 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 AQP2P41181 271 aa13.55□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 UGT2B15P54855 530 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 ZMYND11Q15326 602 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 PARP8Q8N3A8 854 aa13.55□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 CLDN22Q8N7P3 220 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 MOSPD2Q8NHP6 518 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 WNT5BQ9H1J7 359 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 TMEM38AQ9H6F2 299 aa13.55□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 STX1BP61266 288 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 SELPLGQ14242 412 aa13.54□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 RUNDC3AQ59EK9 446 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 ZNF774Q6NX45 483 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 PTOV1Q86YD1 416 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 SPICQ8N5J4 248 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 OR2Z1Q8NG97 314 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 ITLN1Q8WWA0 313 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 KLHL21Q9UJP4 597 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 USH1CQ9Y6N9 552 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 TRAV40A0A0B4J280 105 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 TRAPPC13A5PLN9 417 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 EVPLLA8MZ36 301 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 FUT1P19526 365 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 PPIBP23284 216 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 LAP3P28838 519 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 BTG1P62324 171 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 CD47Q08722 323 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 PSG7Q13046 419 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 MTX3Q5HYI7 312 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 C10orf128Q5T292 105 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 C16orf87Q6PH81 154 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 EPGNQ6UW88 154 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 BRD3OSQ6XYD6 125 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 Q6ZR03 302 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 MREGQ8N565 214 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 CCT8L2Q96SF2 557 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 PRSS27Q9BQR3 290 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 EBF4Q9BQW3 602 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
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