RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546664.2

ACSS3-202, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene ACSS3, Length 379 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3-202ENST00000546664 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 HACD4Q5VWC8 232 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 MED27Q6P2C8 311 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 CASP12Q6UXS9 341 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 PRSS48Q7RTY5 328 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 PIP4P1Q86T03 277 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ZNF740Q8NDX6 193 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 SFXN5Q8TD22 340 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 TBCKQ8TEA7 893 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 TLCD1Q96CP7 247 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 OMA1Q96E52 524 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 MS4A4EQ96PG1 132 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 AGMATQ9BSE5 352 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 MFSD1Q9H3U5 465 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 TMEM38AQ9H6F2 299 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 RDH14Q9HBH5 336 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ABCB9Q9NP78 766 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 SDHAF2Q9NX18 166 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 NUDT4Q9NZJ9 180 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 TMEM9Q9P0T7 183 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 Q9UF83 564 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 KCNS2Q9ULS6 477 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 PSG11Q9UQ72 335 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ACOT9Q9Y305 439 aa3.45□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 MROH7Q68CQ1 1323 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 C9orf84Q5VXU9 1444 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 A0A1W2PR80 420 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 USP27XA6NNY8 438 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ZNF724A8MTY0 619 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 HACD1B0YJ81 288 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 E9PAM4 449 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 F5H5T6 163 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 SLC1A7O00341 560 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 CCRL2O00421 344 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 CXCR6O00574 342 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 CCL21O00585 134 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 INPP4BO15327 924 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 BIRC5O15392 142 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 NDUFA2O43678 99 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 SOX15O60248 233 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 CTSVO60911 334 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 CTDNEP1O95476 244 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 RAB36O95755 333 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 BMP15O95972 392 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 IGHV2-5P01817 119 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 LGALS2P05162 132 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 FGF1P05230 155 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 CTSLP07711 333 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ACSM4P0C7M7 580 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 LIMS3P0CW19 117 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 LIMS4P0CW20 117 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 LIPCP11150 499 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 HLA-DOBP13765 273 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 FUT3P21217 361 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 CRABP2P29373 138 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 GDF5P43026 501 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 OR3A2P47893 321 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 SSR4P51571 173 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 STC1P52823 247 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 CDH11P55287 796 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ERVPABLB-1P60509 514 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 RHOAP61586 193 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 FAM3AP98173 230 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 HMGCS1Q01581 520 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ACVR1Q04771 509 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ZNF91Q05481 1191 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 TNFRSF9Q07011 255 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 FCHO2Q0JRZ9 810 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ARL16Q0P5N6 197 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.861e-14■■■■■ 48.8
ACSS3-202ENST00000546664 SLC39A6Q13433 755 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 KIR2DS1Q14954 304 aa3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ACSS3-202ENST00000546664 ZIC1Q15915 447 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms