RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	AGFG2	O95081	481 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	HRG	P04196	525 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SPARC	P09486	303 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	GAA	P10253	952 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	COX5A	P20674	150 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	AGA	P20933	346 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CD79B	P40259	229 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ENTPD1	P49961	510 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CXCR4	P61073	352 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	PCBD1	P61457	104 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SLC36A2	Q495M3	483 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SHF	Q7M4L6	423 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC18	Q8N456	261 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	STX19	Q8N4C7	294 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF511	Q8NB15	262 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SIAE	Q9HAT2	523 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	AMBN	Q9NP70	447 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658		A0A096LPE4	126 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PPZ6	126 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	PHYH	O14832	338 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SELENOF	O60613	162 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	UBL3	O95164	117 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CLDN14	O95500	239 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	RAB36	O95755	333 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	GPANK1	O95872	356 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	WNT11	O96014	354 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CST2	P09228	141 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC159	P0C7I6	412 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CD79A	P11912	226 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ACTC1	P68032	377 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ACTA1	P68133	377 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	RAB40B	Q12829	278 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	AQP6	Q13520	282 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	GGTLC2	Q14390	218 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	MEP1B	Q16820	701 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	MYDGF	Q969H8	173 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	MNT	Q99583	582 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	WAC	Q9BTA9	647 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	WDR76	Q9H967	626 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	EMC7	Q9NPA0	242 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	JKAMP	Q9P055	326 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	C16orf97	H3BN30	126 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658		J3QKU1	62 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	XPNPEP2	O43895	674 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	APOL3	O95236	402 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	MPZL1	O95297	269 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SBK2	P0C263	348 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	MYL12A	P19105	171 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	TSC22D1	Q15714	1073 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	KCNMB1	Q16558	191 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	FAM27B	Q5VT28	67 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		10.43	□□□□□ -0.74

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