RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 P4HA3Q7Z4N8 544 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 VN1R4Q7Z5H5 301 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OR8H3Q8N146 312 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TBC1D19Q8N5T2 526 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF781Q8N8C0 355 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 B3GNT7Q8NFL0 401 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OR52K1Q8NGK4 314 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OR4L1Q8NH43 312 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ACTL9Q8TC94 416 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MRAPQ8TCY5 172 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 DOK4Q8TEW6 326 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MED18Q9BUE0 208 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 REG4Q9BYZ8 158 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OR8D2Q9GZM6 311 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF350Q9GZX5 532 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 VIPAS39Q9H9C1 493 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SH2D2AQ9NP31 389 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 FAM114A2Q9NRY5 505 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF319Q9P2F9 582 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 LCMT1Q9UIC8 334 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 FBXO7Q9Y3I1 522 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 WIF1Q9Y5W5 379 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 AUP1Q9Y679 476 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 FN1P02751 2386 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 EML6Q6ZMW3 1958 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SH3PXD2BA1X283 911 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PSMD3O43242 534 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SYT7O43581 403 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB14O43829 449 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CD5LO43866 347 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GLSO94925 669 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GOSR1O95249 250 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 THY1P04216 161 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 STMN1P16949 149 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 IL10P22301 178 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 DPP4P27487 766 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SOAT1P35610 550 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ACVR1BP36896 505 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ID1P41134 155 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MARCKSL1P49006 195 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TTPAP49638 278 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 DIO3P55073 304 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RPL27P61353 136 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SKP1P63208 163 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 BTN3A2P78410 334 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RGS1Q08116 209 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ASPHQ12797 758 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 STX4Q12846 297 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CDH17Q12864 832 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KCNJ11Q14654 390 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SLC17A1Q14916 467 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 LTB4RQ15722 352 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 STX1AQ16623 288 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ECSCRQ19T08 205 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PARP6Q2NL67 630 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 LIPNQ5VXI9 398 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SLC22A10Q63ZE4 541 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OPN5Q6U736 354 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CES3Q6UWW8 571 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 HSDL2Q6YN16 418 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA1328Q86T90 577 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 LINC00523Q86TU6 105 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 C17orf64Q86WR6 236 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KLHL7Q8IXQ5 586 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GCNT2Q8N0V5 402 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CA13Q8N1Q1 262 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF321PQ8N8H1 164 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MFSD9Q8NBP5 474 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 APCDD1LQ8NCL9 501 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF740Q8NDX6 193 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 NEIL3Q8TAT5 605 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RDH11Q8TC12 318 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PANX2Q96RD6 677 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 DOHHQ9BU89 302 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GOLPH3Q9H4A6 298 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 LRRC40Q9H9A6 602 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 S100A14Q9HCY8 104 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MED17Q9NVC6 651 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF226Q9NYT6 803 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ARMCX1Q9P291 453 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms