RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 PSD2Q9BQI7 771 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 IFT27Q9BW83 186 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TSSK6Q9BXA6 273 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RIBC2Q9H4K1 309 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 EGLN3Q9H6Z9 239 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 FKRPQ9H9S5 495 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CALHM2Q9HA72 323 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 MCCC2Q9HCC0 563 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHST11Q9NPF2 352 aa4.74□□□□□ -1.65
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MSC-AS1-205ENST00000519068 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 IL20Q9NYY1 176 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 STEAP1Q9UHE8 339 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLEC4AQ9UMR7 237 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RASD1Q9Y272 281 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF835Q9Y2P0 537 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SESN1Q9Y6P5 492 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP24Q9UPU5 2620 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A1W2PRG6 482 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARRDC5A6NEK1 342 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 MCIDASD6RGH6 385 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 DLGAP1O14490 977 aa4.73□□□□□ -1.65
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MSC-AS1-205ENST00000519068 CYTIPO60759 359 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TOXO94900 526 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 NDUFB2O95178 105 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 VAMP5O95183 116 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC2A10O95528 541 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPP1R3DO95685 299 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 BCL10O95999 233 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 YES1P07947 543 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TSPAN19P0C672 248 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 GABRA1P14867 456 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF43P17038 809 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CPT2P23786 658 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGFBP5P24593 272 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTAFRP25105 342 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC6A6P31641 620 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ACVR1BP36896 505 aa4.73□□□□□ -1.65
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MSC-AS1-205ENST00000519068 EFNB1P98172 346 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPP2R2BQ00005 443 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDK5Q00535 292 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 MYBPC1Q00872 1141 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 HGFACQ04756 655 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RBPJQ06330 500 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PUDPQ08623 228 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC17A1Q14916 467 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SNAPC1Q16533 368 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ACKR1Q16570 336 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANKDD1AQ495B1 522 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRBOX4Q5JUW0 171 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 C1orf185Q5T7R7 199 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RAB12Q6IQ22 244 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC35D2Q76EJ3 337 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 DOK3Q7L591 496 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CD163Q86VB7 1156 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 UEVLDQ8IX04 471 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TUSC5Q8IXB3 177 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC43A2Q8N370 569 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPRMLQ8N4K4 120 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 DHRSXQ8N5I4 330 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PACRGLQ8N7B6 248 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SCAIQ8N9R8 606 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 C9orf106Q8NAJ2 232 aa4.73□□□□□ -1.65
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MSC-AS1-205ENST00000519068 OR8D4Q8NGM9 314 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR4K13Q8NH42 304 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SETD6Q8TBK2 473 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABHD3Q8WU67 409 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM171Q8WVE6 324 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CYGBQ8WWM9 190 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 DNAJC9Q8WXX5 260 aa4.73□□□□□ -1.65
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