RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RAD21L1Q9H4I0 556 aa16.83■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.83■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZIM2Q9NZV7 527 aa16.83■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OR5V1Q9UGF6 321 aa16.83■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa16.83■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FMO6PO60774 539 aa16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OR6A2O95222 327 aa16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LYPD3O95274 346 aa16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IGHG1P01857 330 aa16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BPIFB3P59826 476 aa16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RPL15P61313 204 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MTX3Q5HYI7 312 aa16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 REEP3Q6NUK4 255 aa16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF613Q6PF04 617 aa16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LRRC18Q8N456 261 aa16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RAB40AQ8WXH6 277 aa16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF426Q9BUY5 554 aa16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NOX4Q9NPH5 578 aa16.82■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C5orf49A4QMS7 147 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CHP2O43745 196 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 THY1P04216 161 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF32P17041 273 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCNOP22674 350 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MDH2P40926 338 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF84P51523 738 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PPP1CBP62140 327 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PSG4Q00888 419 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HSF2Q03933 536 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PSG7Q13046 419 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 Q6ZR03 302 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NFKBIDQ8NI38 313 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CHIAQ9BZP6 476 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NANSQ9NR45 359 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IL19Q9UHD0 177 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF229Q9UJW7 825 aa16.81■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRAV40A0A0B4J280 105 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRORSD1PA6NEY8 169 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CEACAM18A8MTB9 384 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C5orf58C9J3I9 102 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HDAC3O15379 428 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RNF13O43567 381 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FSTL3O95633 263 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TNFRSF1AP19438 455 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BGNP21810 368 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PROK1P58294 105 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NCALDP61601 193 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CDK6Q00534 326 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 STX3Q13277 289 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TAF9Q16594 264 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KRT73Q86Y46 540 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MSRB3Q8IXL7 192 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HIPK4Q8NE63 616 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NOXO1Q8NFA2 376 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OR10S1Q8NGN2 331 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C10orf82Q8WW14 230 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF607Q96SK3 696 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.8■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC22A31A6NKX4 558 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMEM178BH3BS89 294 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ALX3O95076 343 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CH25HO95992 272 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GDI2P50395 445 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BST1Q10588 318 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MPP2Q14168 576 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C6orf10Q5SRN2 563 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LRIF1Q5T3J3 769 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM27BQ5VT28 67 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BTNL3Q6UXE8 466 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZER1Q7Z7L7 766 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMEM38AQ9H6F2 299 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMEM165Q9HC07 324 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 POMT1Q9Y6A1 747 aa16.79■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRPC5OSA6NMA1 111 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRMUO75648 421 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CRYBA1P05813 215 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TSPAN19P0C672 248 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ACADSP16219 412 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KITLGP21583 273 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TUBG1P23258 451 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CDAP32320 146 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CLRN1P58418 232 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PDCD1Q15116 288 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NPTX1Q15818 432 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BRD3OSQ6XYD6 125 aa16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms