RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 THSD1Q9NS62 852 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF358Q9NW07 568 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OSGIN2Q9Y236 505 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ELOVL7A1L3X0 281 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 CDHR4A6H8M9 788 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 PRR33A8MZF0 331 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 NPIPA5E9PKD4 350 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 NPIPA3F8WFD2 350 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TGFB1I1O43294 461 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TPST2O60704 377 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 GJB5O95377 273 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 CSF1P09603 554 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 FAHP16930 419 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 GOT1P17174 413 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 DIO3P55073 304 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 HMGCS1Q01581 520 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ST3GAL3Q11203 375 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 MEP1BQ16820 701 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 PGGHGQ32M88 737 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 IFI44LQ53G44 452 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SPIN3Q5JUX0 258 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 CPZQ66K79 652 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF626Q68DY1 528 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 CLEC20AQ6ZU45 233 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 XYLT1Q86Y38 959 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 D2HGDHQ8N465 521 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 MDGA1Q8NFP4 955 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 LRRN4Q8WUT4 740 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2FQ969M7 185 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SGPP1Q9BX95 441 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 HRASLSQ9HDD0 168 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 AMBNQ9NP70 447 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 VAX2Q9UIW0 290 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 NPIPA1Q9UND3 350 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SNX10Q9Y5X0 201 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ARL5AQ9Y689 179 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.519e-9■■■■■ 34.6
PDE4D-216ENST00000507116 IL5P05113 134 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TRGC1P0CF51 173 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 FGF5P12034 268 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OMGP23515 440 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 BCL6P41182 706 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TAS2R41P59536 307 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 MAMLD1Q13495 774 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SPHARQ15513 63 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SLC10A6Q3KNW5 377 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 C5orf47Q569G3 176 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 C22orf42Q6IC83 251 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 CMTM8Q8IZV2 173 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OR52E4Q8NGH9 312 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OR52P1PQ8NH57 321 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SMPDL3BQ92485 455 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 KIRREL1Q96J84 757 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 CD180Q99467 661 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGDIGQ99819 225 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ATF6BQ99941 703 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OMDQ99983 421 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ACSS2Q9NR19 701 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OR6C3Q9NZP0 311 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 LIMD1Q9UGP4 676 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 A0A087X1B8 175 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM233B4DJY2 109 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 G3V4G9 280 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 WIPF1O43516 503 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SNAI2O43623 268 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 PDE6DO43924 150 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TOX4O94842 621 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 DCNP07585 359 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 BPIP17213 487 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 NME2P22392 152 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 CYP2F1P24903 491 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 RFX3P48380 749 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ART1P52961 327 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SLC36A2Q495M3 483 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC73Q5JTD7 316 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 PLAG1Q6DJT9 500 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM225Q6GV28 225 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SMIM5Q71RC9 77 aa5.62□□□□□ -1.51
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