RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	COG8	Q96MW5	612 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	IFT27	Q9BW83	186 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf21	Q9H246	121 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	PLCE1	Q9P212	2302 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	SOCS2	O14508	198 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	IMPA2	O14732	288 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	IDH3B	O43837	385 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFS7	O75251	213 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	CCNB2	O95067	398 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	ADRA2A	P08913	450 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM157B	P0CG42	384 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	DAO	P14920	347 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF32	P17041	273 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	GSTM3	P21266	225 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	FPR3	P25089	353 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	LAP3	P28838	519 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	CDA	P32320	146 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	LIPA	P38571	399 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	OMP	P47874	163 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	UCP2	P55851	309 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	TEK	Q02763	1124 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	FMOD	Q06828	376 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	GK3P	Q14409	553 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	RFX4	Q33E94	735 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF525	Q8N782	197 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	ASB9	Q96DX5	294 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	C7orf34	Q96L11	122 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246		Q96M85	177 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX12	Q9BXU0	123 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	DECR2	Q9NUI1	292 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	C5orf49	A4QMS7	147 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	CDC42EP2	O14613	210 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC16A7	O60669	478 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	HLA-DQA2	P01906	255 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	TUBG1	P23258	451 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	GZMK	P49863	264 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPAN31	Q12999	210 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	AQP6	Q13520	282 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC36A3	Q495N2	470 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM209A	Q5JX71	171 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	LCN8	Q6JVE9	175 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	HTRA1	Q92743	480 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	DOK1	Q99704	481 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	SMR3A	Q99954	134 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	SYT3	Q9BQG1	590 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	THTPA	Q9BU02	230 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	SYT4	Q9H2B2	425 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	OR51B6	Q9H340	312 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	OR52D1	Q9H346	318 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	POLE4	Q9NR33	117 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	9.78	□□□□□ -0.84
TTLL3-231	ENST00000496246	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	9.77	□□□□□ -0.85
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		9.77	□□□□□ -0.85
TTLL3-231	ENST00000496246		H7C1C5	153 aa		9.77	□□□□□ -0.85
TTLL3-231	ENST00000496246	SGCE	O43556	437 aa		9.77	□□□□□ -0.85
TTLL3-231	ENST00000496246	DOK2	O60496	412 aa		9.77	□□□□□ -0.85
TTLL3-231	ENST00000496246	PTP4A3	O75365	173 aa		9.77	□□□□□ -0.85
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP5H	O75947	161 aa		9.77	□□□□□ -0.85
TTLL3-231	ENST00000496246	ABHD16A	O95870	558 aa		9.77	□□□□□ -0.85
TTLL3-231	ENST00000496246	IFNG	P01579	166 aa		9.77	□□□□□ -0.85

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