RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	CXCR1	P25024	350 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PTGS2	P35354	604 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC6A8	P48029	635 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	DLX5	P56178	289 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CLDN12	P56749	244 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CLDN20	P56880	219 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	LGALS3BP	Q08380	585 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXF1	Q12946	379 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAM1	Q15629	374 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SGCB	Q16585	318 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PLA1A	Q53H76	456 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	EMC4	Q5J8M3	183 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	HES5	Q5TA89	166 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	LIPN	Q5VXI9	398 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM205	Q6UW68	189 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SNX33	Q8WV41	574 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	EXTL1	Q92935	676 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	YIPF5	Q969M3	257 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	NTNG2	Q96CW9	530 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CRB3	Q9BUF7	120 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	BEX2	Q9BXY8	128 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC22A4	Q9H015	551 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNK15	Q9H427	330 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PRORY	Q9H606	182 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF121	Q9H920	327 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR54	Q9H977	334 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	NLK	Q9UBE8	527 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	MOK	Q9UQ07	419 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ALG5	Q9Y673	324 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SPEG	Q15772	3267 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PRSS37	A4D1T9	235 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730		A8MVM7	634 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730		H0YC42	278 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	DOK2	O60496	412 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	LMX1B	O60663	402 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	RAMP1	O60894	148 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	FZD7	O75084	574 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC43A1	O75387	559 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CCNK	O75909	580 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	IGHE	P01854	428 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	OPN1LW	P04000	364 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CD3G	P09693	182 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	MYL9	P24844	172 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SOX2	P48431	317 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	P2RY4	P51582	365 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC26A5	P58743	744 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ACTA2	P62736	377 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ACTG2	P63267	376 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	HSF2	Q03933	536 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	FMOD	Q06828	376 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CHAF1B	Q13112	559 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CBFB	Q13951	182 aa		5.18	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC17A1	Q14916	467 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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