RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 SYT4Q9H2B2 425 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 RERGLQ9H628 205 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 RASSF1Q9NS23 344 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 CLN6Q9NWW5 311 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 MPDZO75970 2070 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 BSNQ9UPA5 3926 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 DNAJC13O75165 2243 aa6.76□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 SVILO95425 2214 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 FAM183AA6NL82 134 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 SNTNA6NMZ2 147 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 HSPB2A8KAH6 182 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 CCL21O00585 134 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 PRODHO43272 600 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 AHCYL1O43865 530 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 C1QL1O75973 258 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF432O94892 652 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV3-9P01782 118 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 STSP08842 583 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 SPI1P17947 270 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 CRABP1P29762 137 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 OR3A2P47893 321 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 SLC25A1P53007 311 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 CDH11P55287 796 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 RUNX1T1Q06455 604 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 FMODQ06828 376 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 PMPCAQ10713 525 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 MED21Q13503 144 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 GUSBP1Q15486 140 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 HSPB2Q16082 182 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 KLHL12Q53G59 568 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 CPOQ8IVL8 374 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 OR2T4Q8NH00 348 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 RND1Q92730 232 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 RFKQ969G6 155 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM54Q969K7 222 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 Q96MT0 163 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 RBP7Q96R05 134 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 MED20Q9H944 212 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 GLTPQ9NZD2 209 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 PROCRQ9UNN8 238 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 MEMO1Q9Y316 297 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.75□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 A0A1W2PPL8 197 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 OR6C68A6NDL8 312 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 DVL2O14641 736 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 SLC16A7O60669 478 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 FAM20BO75063 409 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 ENTPD6O75354 484 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 TNFSF13O75888 250 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 TOXO94900 526 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 GYPBP06028 91 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 CTLA4P16410 223 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 GNLYP22749 145 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 CTSSP25774 331 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 PYCR1P32322 319 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 OPRM1P35372 400 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 UQCRFS1P47985 274 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 CENPAP49450 140 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF84P51523 738 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 NUDT6P53370 316 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 GLO1Q04760 184 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF91Q05481 1191 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 FOXF2Q12947 444 aa6.74□□□□□ -1.33
GARNL3-218ENST00000487565 APOFQ13790 326 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms