RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 DECR1Q16698 335 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 TMEM35AQ53FP2 167 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 PDSS1Q5T2R2 415 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 OR7E24Q6IFN5 339 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 NFE4Q86UQ8 179 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 DYRK2Q92630 601 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 APH1AQ96BI3 265 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 WDR34Q96EX3 536 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 GAL3ST1Q99999 423 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 RHOXF2Q9BQY4 288 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 NEURL2Q9BR09 285 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ZNF416Q9BWM5 594 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 CSTL1Q9H114 145 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 SDHAF3Q9NRP4 125 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 KLHL9Q9P2J3 617 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 PHF11Q9UIL8 331 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 MKLN1Q9UL63 735 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 PKHD1P08F94 4074 aa3.52□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 PPIAL4EA0A075B759 164 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 PPIAL4DF5H284 164 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 M0R233 179 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 DVL1O14640 695 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 NKX2-2O95096 273 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 LGI1O95970 557 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 CLPTM1O96005 669 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 IGHMP01871 453 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 SPARCP09486 303 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 CCDC159P0C7I6 412 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 PPIAL4FP0DN26 164 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ME2P23368 584 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 KRT20P35900 424 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ASMTP46597 345 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 IER3P46695 156 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 NPY2RP49146 381 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 RGS4P49798 205 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 RAP1GDS1P52306 607 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 C17orf67Q0P5P2 114 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 GAGE5Q13069 117 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 GAGE6Q13070 117 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 CHIT1Q13231 466 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 GTF2H2Q13888 395 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 OR52E8Q6IFG1 317 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 HSCBQ8IWL3 235 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 CNTN4Q8IWV2 1026 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 SLC43A2Q8N370 569 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 TMEM86BQ8N661 226 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 KLHDC1Q8N7A1 406 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 OR7G3Q8NG95 312 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 OR7G2Q8NG99 324 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 OR4F15Q8NGB8 312 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 OR4C3Q8NH37 302 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ZFP90Q8TF47 636 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ANKRD7Q92527 254 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 UPRTQ96BW1 309 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 CMTM7Q96FZ5 175 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ZNF681Q96N22 645 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 RCHY1Q96PM5 261 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 EGFL8Q99944 293 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 CCDC68Q9H2F9 335 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 NOX3Q9HBY0 568 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 TMEM165Q9HC07 324 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ZFP57Q9NU63 452 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 FBXO5Q9UKT4 447 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 TCF19Q9Y242 345 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 CFL2Q9Y281 166 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 CMAHPQ9Y471 501 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 DNAH2Q9P225 4427 aa3.51□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 A0A087WZY1 265 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 A0A1B0GW55 424 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ISPDA4D126 451 aa3.5□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms